Basic Information
Symbol
hsa_DENND4C_0006100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0138397
hsa_circDENND4C_018
hsa-DENND4C_0020
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19288594-19328160
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19288596-19328162
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-400.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-434.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
435.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((...((((((.(.(((.((((((.((.(((.((((...((((....))))...)))).))).))))))))..))).)))))))..((((...)))).......(((((((((.((((...........))))..)))...))))))..(((....))))))))))))..............)))((...((((((((((((((((((..((((((((((((...(((..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((((((((.....((((((.(((((((((((((((.((((..(((..((((((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))((((((((((.......((..(((...(((.((.((((.(.((((((((((((((........))))...))))(((...((((((.........)))))).))).....(((.((......)).)))....)))))).).)))).)).))))))..)))))))))))).....)))))).....(((((((.(((((((......((((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))))((....))((((((.........)))))).(((....)))...))))))).)))))))..)))..).))).............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))....)))))))))))))))..((((....(((.((((....(((...(((((......)))))...)))................(((.(((((......)))))))).)))).)))....))))((....))....)))))).))))).))))))))))))..........((((.(((..(((((((....))))....)))..))))))).....))))))))))).......(((((((((.....))))))))).((((.......((((.....))))....)))).)))))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((,..,{((((.(.{{(.{(((({.,,.(((.((((...((((....))))...)))).))).,,,)))))..))).}))))|{{((((..{{{,||.......,,,.{{||,,}|{,.},.,}))}.,}}}}.{{{{{...)))))..,{,...,}}})))))))))}|,...........,}}{{...{({{{(((((((((((((..((((((((((((...(((..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..(((({({{.,((,((((((,(((((((({{(((((,,(({{{{(,,,((.({{.{(((((({....,{{{,,,,,,...})}),,,,,.,{{||{.,,,,)}))))}.})))).}}},|||.{{{.,,,{|||||,.{|||,....||||,,(({,....,,},,,..(((((((.((({....,{{{((({.....(((({......}}}}}...,,.((((((((((((.............{{..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))}.,)))))).,,...((((((({.((((((...,.,.((....)).......))))))....(((((...)))))....,,{..((((.,........,,.)))),,,.......})))))))..((((.((((.((((........)))).)))).)))}...{(((((.......,.}))))),{||,{...|||.||,,....)),})),}...,.)}}|||||||||...}|}}||||{|....,||{||,,..))}})},,,,,||{{{((,((({{{{.,,},,{{{{{{.|{{|{{||,|{{{..,,,,,,.,,))))....|||,|||}|,...}}}))}{(....))|{{{{,....,}|||||||||,,((,,..}},...||||}}}.}||||||||}},,|||}}}},,,,,,,..,..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).}))))),,,}})))))))}}})))))))}....,))),....,.,..|||.,,|||||,.,,,,)))}}...}}}...,}}||||||.,{((((.(((((......)))))))).)))|.}},,,.,}|},{,.,|.}}....)))))}.},))).)))))))))))).....{,...{{{,.,{{..||{((((....))))....}}}..}}}})}}.,...)))))))))))},,,,{{({{{{{({{...,,|}}}}))),.|{{{...,}},||{{.....}}}|...,)}},.}))))}}....))
Forensic Context
No forensic context available.