Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0007800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114973 hsa_circITCH_013 hsa-ITCH_0009
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33000321-33030108 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34412515-34442303 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-248.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -264.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))((..(((((.....)))))..(((((((.(((.....))).)))).)))(((((((((...((.(....).)).))))))))).............(((((((..(((((.....((((....)))).))))))))))))......(((((((......((((....(((((((...((......))...)))))))....))))..........((((((..(((((((...)))).....)))..))))))....(((((((.(.(((((((((((..(((((.((((....))))......((.(((((..(((((.........)))))..))))).))(((..(((((((((((.(((((.(((......))).)))))........((((...((((((((((((...((....((.(((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))).))...))..))))))).((...(((.....)))....)).........................)))))..)))).(((........))).............)))))))..((((...))))...................((((((..(((....))).)))))).))))..))))))))..))))..((((((...))))))(((((((.........)))))))))))))).).)))))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..,,||((,,(((((.....)))))..(({((((.(((.....))).)))).)))(((((((((...((.,....).}}.))))))))).............{{{{{((,.,{{{{.....((((....)))),|||||}}}}})),,}},.((({{{|||....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))..........((((((,,({(((((...))))}.,,.,)}..))))))....(((((((.(.(((((((((((..(((((,{((({....))),.....{{.(((((..(((({,........)))))..))))).})(((..(((({((((((.(({((({(({{.,,,|||{{((((({((({.,({((.{{(({{{(((((((...{{....((.(((((.(((....(((((((..(((({{{{.,,,,{|}||.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,..}))})),}}})))).))))))).....)))))))).))...})..))))))).|,...(((.....)))},,.,}.................,,}}}}..))))),.}}}}.(((........))).....,,,,.)),))))))}..((((...)))).......,,,},.,,,}..((((((..(((....))).)))))).))))..))))))))..))))}.((((((...))))))(((((((.........))))))),}))))).).)))))))))}}}}).))
Forensic Context

No forensic context available.