Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0010600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0059939 hsa_circITCH_021 hsa-AL109923_0008
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33001548-33057925 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34413742-34470120 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-309.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -330.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 331.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....((..((((((.(((.(((((.(((((((.....(((((..((((.....((((((.((((((((......))))))))...(((.......))).((((.(((((...)))))))))....(((((((...(((((((((((.((.((.((((...(((((((...((....((.(((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))).))...))..)))))))......(((.....))))))).))................)))))).)))))))...))))))).........)))))).....))))..))))).((((...))))..............(((..((((((..(((....))).)))))).)))(((((((..((....))..))))))).(.((..((((((((.........))))))))..)).)..........))))))).))))).))).....((((((((..(((((.....)))))..))))))))...))))))..))..)))(.((((....))))(((((((((.....((((((...(((((....((.(((((...)))))..((((....)))).(((.(((((..........(((((........))))).........))))).)))(((((((((..((((((.((((.(((((((((((((((.(((..((...........))..)))...))))...((.((.(((((............))))).)).))..((((.....))))..........(((......)))....(((..(((....))).))).)))).)).))).)).)))).))))))..))))))))).......((((..(......)..))))..((.((((.(((.(((...(((((.((........))....)))))..))).)))..)))))).....))....)))))....)))))))))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..{,,((,.(((({{{(((,({{((.{{{|||{||...{((((..,,(({{{{{,,,((,.....||...}}}}}))..,,)))}.,.,....,,|||{,((((,(((((...))))}}}}}.},.,||||||...|||||||{{{,.{,.,,.{(((.{{((({((,...,,....{{.(((((.(((....(((((((..(((({{{{.,,,{{|}||.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,..}))})),}}})))).))))))),..,.)))))))}.)}...|,{{|||||||{{{...(((.{{{{|||||,,.................,.|,}}}},.|||||}...}|}||||........,||||,,.....}}})},))}}}.((((...))))......,,|.....(((..((((((..(((....))).)))))).}})(((((((..((....))..)))))))...||..{(((((((.........)))))))|,.||.|.......,)))}})})),))))),},,,}}},||||{,{{.,{((({{,|||,,,.,}}))))},))..,||,,,,,,},..,,.,}||||}}}}))),,,|||||||}}}}}|{((((.{,(((((....((.(((((...)))))..((({....)))).{((.(((((...,,.....(((((........))))).....,,,.))))).))}(((((((((..((((((.((((.(({(({(((((((((.(((..((...........))..)))...)))),{,((.{(,((({(,,,,,.......,}}},.,,.,,..((((.....))))...,,.,,{{{{,......}}}....,||,.{{|....))),))),}))).})))),.)).)))).))))))..))))))))).......{{{(..{......,..}}}}..,{.{{((,(((.(((...{((((.((........))....)))))..))).))).,)))},,.....))....))))).},.))))))})))))}))},}
Forensic Context

No forensic context available.