Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0013200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0059941 hsa_circITCH_025 hsa-AL109923_0057
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33012286-33030108 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34424480-34442303 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-131.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -138.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 123.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.((((..((((...((((((((((((...((....((.(((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))).))...))..))))))).((...(((.....)))....)).........................)))))..)))).(((........)))..........))))))))).).((((...))))..............(((..((((((..(((....))).)))))).)))(((((((..((....))..))))))).(.((..((((((((.........))))))))..)).)((((............))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{((((((((,,{((((,{{((((((((((((...{{....{{.(((((.(((....(((((((..(((({{{,.{{{{{|}||.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,..}))})),}}})))).)))))))...,.)))))))).)}...})..))))))).{{...(((.....))),,..}}...................,,},..)))))..)))).(((........))).,,.......}}}))}}||.,.((((...))))......,||.....(((..((((((..(((....))).)))))).))){((((((..((....)),.))))))).,.||..|{((((((.........)))))))|{.||,{...,....))}}}},.})))
Forensic Context

No forensic context available.