Basic Information
Symbol
hsa_ITCH_0016300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114982
hsa_circITCH_029
hsa-AL109923_0049
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33026279-33080402
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34438474-34492597
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-501.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-536.57 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
434.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))(((((.(((((.((((((((.....((((.((.................................)))))).....))))).........))).))))).....((((((.((.((((...))))..............(((..((((((..(((....))).)))))).)))(((((((..((....))..))))))).(.((..((((((((.........))))))))..)).)...)).))))))(((((((.((((.(((((((((((..((((((((..........))))))))..(((((((((...........((((((..((((((((((((((.....((((((...(((((....((.(((((...)))))..((((....)))).(((.(((((..........(((((........))))).........))))).)))(((((((((..((((((.((((.(((((((((((((((.(((..((...........))..)))...))))...((.((.(((((............))))).)).))..((((.....))))..........(((......)))....(((..(((....))).))).)))).)).))).)).)))).))))))..))))))))).......((((..(......)..))))..((.((((.(((.(((...(((((.((........))....)))))..))).)))..)))))).....))....)))))....))))))))))))))).......))))).))))))..(((............)))....(((...(((((((((..((......))..)))))))))...))).(((((((......(((....)))...)))).)))(((((.....))))).(((((((..(((....((((.(((((((((.......))))))))).))))...))))))))))(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.((((((.((((((((((..(((...((((((((((.((((((......)))))).((((((.....))))))(((...(((((.(((.(......(((((....(((........)))..)))))...).)))...)))))..))).(((((.(((((((((...))))).))))))))).........((((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))).(((((.((((((((.(((....((.(((.....))).))....))))))...((..(((....)))..))...(((((.......)))))......))))).)))))....)))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..)).))))))))))))).)))....((((((........))))))..)))))))))(((....))).....(((((((((((......)))))......)))))).(((.(((((((.((.........))))))))).)))..(((((((.....)))))))..(((((.........))))).((((.....)))).))))))))).)).)))))))))))...........))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((,,(({...,{(((((({.{(,{(((,.,,,{{||||.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,.,}))})).}}}}|,,.||||||||,,|,||}||{{(....,}}}},,,{((({{(,...(((.,,..|||.{{,,,..................,,,}..,||{,...,.}}}(((,.......}}}..,.........|))|})}...||||,,,)))).......,,.....{{{..((((((..(((....))).)))))).))){||||{{,.((....))..))))))}...|{..{(((((((.........)))))))}..}|,|,,,|,..,}}}.((((((,{((((.(((((((((((..,,,,(((({{{{{{....,)))))),.}|||{((....},........((((((..((((((((((((((.....((((((.{,(((((....((.(((((...)))))..((((....)))).(((.(((((...,,.....(((((........))))).....,,,.))))).)))(((((((((..((((((.((((.(({(({(((((((((.(((..((...........))..)))...)))),,,((.{(,((({(,,,,,.......,}}},.,,.,,..((((.....))))...,,.,,,,{{,......}}}....,||,.{{{....))),))),)))).})))),.)).)))).))))))..))))))))).......{(((..{......,..}}}}..,{.{{((,(((.(((...{((((.((........))....)))))..))).))).,)))},,.....))....))))).,}.))))))))))))))).......))))).))))))...............((((((((((,,...(((((((((..((......))..)))))))))..,|||,{{(((((.{{((({,,.,,,..|||.|}|}.},}|,{||,,.,,)},,,.{{{{{{|,,|,|,,..((((.(((((((((.......))))))))).))})...}}}}))}))}(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.(((({{{((((((((((..((({..((((((((((,({{(((,,{,,,}||||..((((({.....}))))}{((.,.(({((,{{((,,..{{{({(((.,,,(((........)))..}}}}}...,,}.}}}})))}}..))}.,{(({.(((((((({...})))}.}))))))|{{,.......||||.{{{{.,,,,|||,,..,.))).,,,,)}})),,,)))))))))).(((((.((((({{,{(((....{,.{((.....))).},....))))}}...{(..(((....)))..)).,.(((((.......)))))......))))).)))))..}.}))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..))},)))))))))))).))).,,.{(((((........)))))},,}}}}}|||}({{....}}},,,,.(((((((((((......)))))......)))))).(((.{((((({.{{.........}}))))))}.))}..{((((({.....))))))}.,(((((.........))))).||,|}}))))))).))))))))).)).)))))))))))...,}))}}}))}},,}
Forensic Context
No forensic context available.