Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0008000
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0138403 hsa_circDENND4C_026 hsa-DENND4C_0111
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19290702-19328160 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19290704-19328162 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-385 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -414.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 410.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((((....(((..(((((.((..((((.......))))..))............((((((..(((.((((((.(((.(((((((..(((((((((((...((............)).)))))))...((((((((((((..((((((((((((...(((..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((((((((.....((((((.(((((((((((((((.((((..(((..((((((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))((((((((((.......((..(((...(((.((.((((.(.((((((((((((((........))))...))))(((...((((((.........)))))).))).....(((.((......)).)))....)))))).).)))).)).))))))..)))))))))))).....)))))).....(((((((.(((((((......((((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))))((....))((((((.........)))))).(((....)))...))))))).)))))))..)))..).))).............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))....)))))))))))))))..((((....(((.((((....(((...(((((......)))))...)))................(((.(((((......)))))))).)))).)))....))))((....))....)))))).))))).))))))))))))..........((((.(((..(((((((....))))....)))..))))))).....)))))))))))))))).....)))))).).)))...))))))..)))....))))))....)))))..)))))))))))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((((((....(((..(((((,{,..((((.......}}}).,|},...,...,...{|||{|,,||{.{(((((,(((,({(((({..(((((((((((...,{..........,,}..})))))}..,((((((((((((..((((((((((((...(((..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..(((({({{.,((,((((((,(((((((({{(((((,,(({{{{(,,,((.({{.{(((((({....,{{{,,,,,,...})}),,,,,.,{{||{.,,,,)}))))}.})))).}}},|||.{{{.,,,{|||||,.{|||,....||||,,(({,....,,},,,..(((((((.((({....,{{{((({.....(((({......}}}}}...,,.((((((((((((.............{{..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))}.,)))))).,,...((((((({.((((((...,.,.((....)).......))))))....(((((...)))))....,,{..((((.,........,,.)))),,,.......})))))))..((((.((((.((((........)))).)))).)))}...{(((((.......,.}))))),{||,{...|||.||,,....)),})),}...,.)}}|||||||||...}|}}||||{|....,||{||,,..))}})},,,,,||{{{((,((({{{{.,,},,{{{{{{.|{{|{{||,|{{{..,,,,,,.,,))))....|||,|||}|,...}}}))}{(....))|{{{{,....,}|||||||||,,((,,..}},...||||}}}.}||||||||}},,|||}}}},,,,,,,..,..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).}))))),,,}})))))))}}})))))))}....,))),....,.,..|||.,,|||||,.,,,,)))}}...}}}...,}}||||||.,{((((.(((((......)))))))).)))|.}},,,.,}|},{,.,|.}}....)))))}.},))).)))))))))))).....{,...{{{,.,{{..|{{((((....))))....}}}..}}}})}}.,...)))))))))))))}}}..,..}}}})).}.}}).,.)))))}..)))...,)))))),...}))))..)))))))))))))(.....)
Forensic Context

No forensic context available.