Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0017600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0059945 hsa_circITCH_032 hsa-AL109923_0082
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33027960-33037285 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34440155-34449480 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-141.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -152.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.