Basic Information
Symbol
hsa_ITCH_0017900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114985
hsa_circITCH_035
hsa-AL109923_0044
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33027960-33059320
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34440155-34471515
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-226.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-242.44 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
267.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((..((((....))))....(((((....)))))(((((((((((...(((.(((((((((................((((((.(((.(.(..(((((....(((........)))...........((((.(((....)))))))(((......(((....((((..((((((..(((....))).))))))...)))))))(((((.((((...((((((...))))))(((((((.........)))))))((.((((........)))))).)))))))))....)))..)))).)..).).))).))))))....(((((.....(((....))))))))..))))))))))))...))))).))))))..((((((.(((((((((....((.((..((((((.((((....)))).(((.(((((..........(((((........))))).........))))).)))(((((((((..((((((.((((.(((((((((((((((.(((..((...........))..)))...))))...((.((.(((((............))))).)).))..((((.....))))..........(((......)))....(((..(((....))).))).)))).)).))).)).)))).))))))..))))))))).............(((((.....((....((.((((.(((.(((...(((((.((........))....)))))..))).)))..))))))....))....))))).((((..(((((((((....))).))))))..)))).............))))))..))...)).....))))))))).)).)))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((({{(((....})}},{{{((,({,...,||||(((((((((((...(((.(((((((((.,.....................,,,...{((((..,.{{,((({,..,....||,,|......,,}})))})|,,.((((...))))......|||.,...(((..((((((..(((....))).)))))).||)|||{{{(,,((.,,,|}..||||||}..,||,.|(((((((.........)))))))|{.||,{.......,))),,),)))}))}))...})))})}|||.,..,{{{|||,|||,,,..}}))))|.}},,{{{....}},.......))))))))))))...)))))}})))))}|{{{{,|.{|||{..||||,|({,{...|||||{.((((....)))).{((.(((((...{,.....(((((........))))).....},,.))))).))}(((((((((..((((((.((((.(({(({(((((((((.(((..((...........))..)))...)))),{,((.((,((({(,,,,,.......,}}},.,,.,,..((((.....))))...,,.,,{{{{,......}}}....,||,.{{|....))),))),}))).})))),.)).)))).))))))..))))))))),,,,,..{{,{..(.{{{..,..||.,..{(.((((.(((.(((...{((((.((........))....)))))..))).)))..)))}}}.....},...}))}},||||}))||||||||||{{|||...})))|..}))}}..}},......}}}}}}..))}},})}....,.|||||,{{{{...}))},.}))))
Forensic Context
No forensic context available.