Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0019000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114988 hsa_circITCH_040 hsa-AL109923_0029
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33030013-33050026 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34442208-34462221 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-135.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -144.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.