Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0023000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0059954 hsa_circITCH_049
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33049898-33092208 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34462093-34504403 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-290.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -314.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 348.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..........(((..(((....))).)))........(((((((...((((....))))...)))))))(((((.(((((..........(((..(((((..((.....))...)))))...))).....(((((((......(((.(((..((((((...((((.........((((..(((((((((....))).))))))..)))).....(((............)))..........(((((((((..((......))..))))))))).)))).))))))....(((((((((....)))))))))..((((((.....))))))(((((((..(((....((((.(((((((((.......))))))))).))))...))))))))))(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.((((((.((((((((((..(((...((((((((((.((((((......)))))).((((((.....))))))(((...(((((.(((.(......(((((....(((........)))..)))))...).)))...)))))..))).(((((.(((((((((...))))).))))))))).........((((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))).(((((.((((((((.(((....((.(((.....))).))....))))))...((..(((....)))..))...(((((.......)))))......))))).)))))....)))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..)).))))))))))))).)))..))).))).....))))))))))))))))).........))))))(....((((((((((......))))........((.(((((...(((.(((((((....((...((((.(((((((.(((((((.....)))))))..(((((.........))))).((((.....))))....)))))))..))))....))...))))))).)))))))).)).(((((.....((((...)))))))))......(((((..((........)).))))).))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((...,......(((..(((....))).)))...,,.,.{|{|{{({{{(,,,...})))).{{{|||||.((({,{((({,{..,...,..|||,..,{.({((({,,,{{|...,||||.,{,,......||((({{,||,..(({.{{{..(({(((...,{{{...,{{,,.((((..(((((((((....))).))))))..}})),,..||,{............|||,{,,,,....(((((((((..((......))..))))))))).|||},|}}|||,{.,((((({{,,....|||}||||}..,{{{||,,.},)}}},,{{{{|||,,|,|,,.,|{{{,||(((((((.....,.))))))))),))}),,,))})))))))(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.(((({{{((((((((((..((({..((((((((((,({{(((,,{,,,}||||..((((({.....}))))}{((.,.(({((,{{((,,..{{{({(((.,,,(((........)))..}}}}}...,,}.}}}})))}}..))}.,{(({.(((((((({...})))}.}))))))|{{,.......||||.{{{{.,,,,|||,,..,.))).,,,,)}}))},,)))))))))).(((((.((((({{,{(((....{,.{((.....))).},....))))}}...{(..(((....)))..)).,.(((((.......)))))......))))).)))))..}.}))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..))},)))))))))))).)))..}}}.}))..,,.)))))))}))}})))))..,}}},,,}})))}{..,.((((((((((......))))}.,....||||||,{,,..{{{.(((((((....((...((((.(((((((,{{{{{.,{.,{{|||}|},,,{((((.........))))),||||}|.}||}}|,}},}))))))..)))).,,.})...))))))).)))},||||}|,{,,||,.||,||||..{||}..,,,}},....|||||...,....,,,,}}.)))),.}))))}.,..)
Forensic Context

No forensic context available.