Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0024300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0059957 hsa_circITCH_053 hsa-AL109923_0017
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33057853-33080402 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34470048-34492597 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-249.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -266.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 217.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.