Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0026200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114993 hsa_circITCH_055 hsa-AL109923_0039
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33059249-33069011 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34471444-34481206 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-132.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -142.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 125.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...(((....)))....(((((.((((((..(((((((((..((((((.((((((((...((((((..(((.((...((((.((((.....(((((((.((((..(((((((((......((((((..((((((.....((.((((((((((((((((.......))))))))..((((...((.....))...)))).((.(((((........))))).))......)))).)))).))..))))))...))))))..........))))))))).)))).)))))))....))))..))))....)))))...))))))....))).))))).))))))...)))))))))...))))........))))))).......)))))))...(((((((((...))))).))))((((((...(((((.(((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))).(((((.((((((((.(((....((.(((.....))).))....))))))...((..(((....)))..))...(((((.......)))))......))))).)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{((((...{({,,..}|,.....((({{,..(((,.{((((((((..((((((.((((((((...((((((..(((.((...((((.((((.....(((((((.((((.,(((((((((......((((((..((((((.....((.((((((((((((((((.......))))))))|,{{{{...|||,,|.,,.,.}}|,.((.(((((........))))).)}......)))).)))).))..))))))...))))))..........))))))))),)))).)))))))....))))..))))....)))))...))))))....)))}}}))).))))))...))))))))),,,,,,}.,......}},||||,,.....}}})))},,.(((((((({...})))).))))|||(((...(((({,(((.((((.....(((......))).....))))))))))))}})}}}.((({{.{{{{{||||{{{....,,.{{|...,,}}}.}}..,,))))}},,.{(..(((....)))..)).,.(((((.......))))}......})))).)))})...
Forensic Context

No forensic context available.