Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0026300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114994 hsa_circITCH_056 hsa-AL109923_0042
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33059249-33080402 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34471444-34492597 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-225.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -244.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 239.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((((((((.(((............)))....(((...(((((((((..((......))..)))))))))...))).(((((((......(((....)))...)))).)))(((((.....))))).(((((((..(((....((((.(((((((((.......))))))))).))))...))))))))))(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.((((((.((((((((((..(((...((((((((((.((((((......)))))).((((((.....))))))(((...(((((.(((.(......(((((....(((........)))..)))))...).)))...)))))..))).(((((.(((((((((...))))).))))))))).........((((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))).(((((.((((((((.(((....((.(((.....))).))....))))))...((..(((....)))..))...(((((.......)))))......))))).)))))....)))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..)).))))))))))))).)))....((((((........))))))..)))))((..(((....)))..)).(((((((((((......)))))......))))))......(((.(((((((....((...((((.(((((((.(((((((.....)))))))..(((((.........))))).((((.....))))....)))))))..))))....))...))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....)((((({{{(({(({.......,..{,{{((({{({,...(((((((((..((......))..))))))))).,,|}|,{{(((((.{{((({,,.,,...|||.||||.,,|{,{||,,.},)},,,.{{{{{||,,|,|,,.,|{({.(((((((((.....,.))))))))),))})...))})))}}}}(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.(((({{{((((((((((..((({..((((((((((,({{(((,,{,,,}||||..((((({.....}))))}{((.,.(({((,{{((,,..{{{({(((.,,,(((........)))..}}}}}...,,}.}}}})))}}..))}.,{(({.(((((((({...})))}.}))))))|{{,.......||||.{{{{.,,,,|||,,..,.))).,,,,)}})),,,)))))))))).(((((.((((({{,{(((....{,.{((.....))).},....))))}}...{(..(((....)))..)).,.(((((.......)))))......))))).)))))..}.}))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..))},)))))))))))).))).,,.{(((((........)))))),,})))},,,,((,....}||,,,,.{((((((((((......)))))......)))))).|||,.(((.(((((({....{{...((((.(((((((.{({({,{,..,,|||}|,,..(((((.........))))).}}||}},)}}))}.}}|}))))))..)))).,,,)}...))))))).))})))))
Forensic Context

No forensic context available.