Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0027300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114996 hsa_circITCH_061 hsa-AL109923_0024
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:33065577-33092208 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34477772-34504403 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-225.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -243.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.((((..(((((((((((.(((((..(.((((..(((((((....((((.......(((((((..(((....((((.(((((((((.......))))))))).))))...))))))))))(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.((((((.((((((((((..(((...((((((((((.((((((......)))))).((((((.....))))))(((...(((((.(((.(......(((((....(((........)))..)))))...).)))...)))))..))).(((((.(((((((((...))))).))))))))).........((((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))).(((((.((((((((.(((....((.(((.....))).))....))))))...((..(((....)))..))...(((((.......)))))......))))).)))))....)))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..)).))))))))))))).)))(((.((((((........)))))))))...((((.(((....))))))).(((((((((((......)))))......)))))).(((.(((((((.((.........))))))))).)))..(((((((.....)))))))..(((((.........))))).((((.....))))...))))..)))))))..)))).)..))))).)))))..)))))).(((((.....((((...))))))))).......((((..((........)).)))))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((.((((..(((((((((((.(((((..(.((({{,(({,,{({(((,,.,.}}},,.(((((((..{((....((((.(((((((((.......))))))))).))))...))})))))))(((.(((((((......((((((((.(((((((((........((((.(((({{(((((((((((..((({..((((((((((,({{(((,,{,,,}||||..((((({.....}))))}{((.,.(({((,{{((,,..{{{({(((.,,,(((........)))..}}}}}...,,}.}}}})))}}..))}.,{(({.(((((((({...})))}.}))))))|{{,.......||||.{{{{.,,,,|||,,..,,))).,,,,)}})),,,)))))))))).(((((.((((({{,{(((....{,.{((.....))).},....))))}}...{(..(((....)))..)).,.(((((.......)))))......))))).)))))..}.}))..))..)))))).))))))))))))(((((........)))))((((((((...)))))))).......)))))))))..))},)))))))))))).))),{,.{{{{({......,,|||}},,,|,|.,{{{,(({....}}},|}}.{((((((((((......)))))......)))))).}}|},|||||,|||||}...{{..,||{{.{((((((.{{{({,{{..,,|||||,...(((((.........))))).||||},.},,)),,)}}))))))),,)))}.,,,),)..))))).)))))..)))))).(((((.....((({...))))))))).......((((..{(........)).)))))))))))).....
Forensic Context

No forensic context available.