Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0095
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:32957200-33050026 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34369394-34462221 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-454.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -484.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((.....)).)))(((.((((....)))).)))..........(((((..((((.....)))).)))))(((((....)))))...(((((((..((((((((((.(((..(((((((((..((((.........))))..))))).)).))..)))))))))).((((((((((((...................(((((....)))))((((((((............))))..)))).(((......))).......(((.....(((............)))...)))....(((((((............)))))))...((((.(((((.((((.(((.....))).)))).))))).))))))))))))))))(((((((((((..................((((((..(((((.....((((....)))).)))))))))))((..(((((((.((((....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...(((..((.(((..((((((......(((((((((.(((.........))).)))))))))....((((...(((((((.((((....)))).)).)))))....))))((((((((......((((..((((..........(((((((.(((..((((((((.(((((((.(((((.((((..((((...((((((((((((...((....((.(((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))).))...))..))))))).((...(((.....)))....)).........................)))))..)))).(((........)))..........)))))))))...((((...)))).......)))))))(((..((((((..(((....))).)))))).)))(((((((..((....))..)))))))........(((((((.........)))))))((.((((........)))))).))))))))....))).)))))))....((((((((((.....))))))..)))).))))..))))........))))))))......(((((.....))))).......))))))..)))))..)))...)))).)))))))..))))))))))))).........(((((........)))))....((((((.......((((((((((..((((((.((((.(((((((((((((((.(((..((...........))..)))...))))...((.((.(((((............))))).)).))..((((.....))))..........(((......)))....(((..(((....))).))).)))).)).))).)).)))).))))))..)))))))))).....)))))))))..)))))))...............))(((.........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,..,{,,,,,|,.(({(((.((((....)))).)))...}}}....|{{{{..((({.....}))).})}}}{((({,,,,}}}||,,.(((((((.,((((((((({{(((..{{(((((((,.((((,......,.))))..))))).)).}}..)))))))))),{(((((((((((...,{{,............{((((....})))}{||||{|{,,.,..,{{.{,}},,.,)))).(((......))).......{({.....{{{......,.,...}}),..}},....(((((((.,,....,,...)))))))....,,,.{{(((,((((.(((.....))).)))).)))))}),,,)))))))))))|(((((((((((.{({.{{,(,,...,,.,}}|}))...{{.{,{....,(({.,((((((.((((((((|.((.{((((((((((({....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...,,,...,{((({({{({(((((...))))},,},,)}..}))))}...,((((..(((((.,,...((((((((.((((((((...{{|{{....}})),,,.))))..)))}))))...))))...)))))..)}))..,,||,|)))}}})))}.)).}))}}})))).)))))))}}}..,.}}}.}}(((((.{((({{..,,|...,(..,,||{.{{|....||||||{..((({,{((,,,,,{(|{{.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,..}))})),))))))}.|||}}}}}},,,|||||,||{|,...{,((((((((((((...(((.(((((((((.......................,,,...{{{({..,.|{,((({,......,||,,,.......,}})))})}...((((...))))......|||,,,..{((..((((((..(((....))).)))))).||}{((({{(,.((..,,)}..}}}}}}}..,||..|(((((((.........)))))))|{.||,{.......,)))},),))})))))},..})))}))|||.,,.,{|{|||,|||,,,..}})))}|.}},,,{{....}},...,...))))))))))))...)))))},)))))),,..,,,.,|}}...}||}}|{{,{.,,}},))}}}}}}},.)))))))))))))))),....,,..{{{{{......|{|||||,{{,(({.(((({{........,})))}}|||}}}}}}||}{{{((((((((((((.(((..((...........))..)))...))))){{((.(({(((,({{{{{.......,,,,,..,..,..{(((.....))))...,|.{{{{{{,......,}}.....}}}}}}},...)))))))))))).,)))),,,|{|||,.,...))}}),..,}))))}}}}....,},})}.,)))))))...,,,}........))(((.........)))
Forensic Context

No forensic context available.