Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0001400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0150
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:32957200-33080402 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34369394-34492597 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-726.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -772.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 728.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((..((((((.((((....)))).)))...)))....)))))).......((((((((.((((..(((((((......(((.(((...(..((((((((.(((..(((((((((..((((.........))))..))))).)).))..))))))))))).)))).))).......)))))))..))))..(((((....)))))((((((.(((((.(...((.(((((((..((((((..(((..(((.....((((....((((.....(((.....))).((((((((...(((((((((((.....(((((.....))))).((((((((.(((.....))).)))).)))).(((((((....(((((((((((((((((..................((((((..(((((.....((((....)))).)))))))))))((..(((((((.((((....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...(((..((.(((..((((((......(((((((((.(((.........))).)))))))))....((((...(((((((.((((....)))).)).)))))....))))((((((((......((((..((((..........(((((((.(((..((((((((.(((((((.(((((.((((..((((...((((((((((((...((....((.(((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))).))...))..))))))).((...(((.....)))....)).........................)))))..)))).(((........)))..........)))))))))...((((...)))).......)))))))(((..((((((..(((....))).)))))).)))(((((((..((....))..)))))))........(((((((.........)))))))((.((((........)))))).))))))))....))).)))))))....((((((((((.....))))))..)))).))))..))))........))))))))......(((((.....))))).......))))))..)))))..)))...)))).)))))))..)))))))))))))))..)))).(((((........))))).((((((.((((((.........))))))))))))..(((((((.....(((((((((....((((.....(((.(((((..((((((..(((((((((((((........))...((((((((....((((.....))))....((((((((..(((((.(((((((((...((((...((.((((.....(.(((((((...((((....))))...))))))).)...((((..(......)..)))).....)))).)).)))).(((((((((...((((..(((((..(((((((((.((((..(.....)..)))).))))....)))))..)))))...)))).((...((((...))))..))......(((((.....(((..(((...(((((((((..((......))..)))))))))...))).))).....)))))(((((((.((((..(((((((((......((((((..((((((.....((.((((((((((((((((.......))))))))..((((...((.....))...)))).((.(((((........))))).))......)))).)))).))..))))))...))))))..........))))))))).)))).)))))))......))))))))).((.((((((.......)))))).))............))))))))).)).........)))..).))))))).........(((((.(((((((((...))))).))))))))).........((((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))))))))))))..))))))((..(((...)))..))..........))).)).)))....))))..))))))))).(((((.......)))))....)))))))..))))))))))))))))))...)).)))))).((((((((((((((((.......((((((((...))))))))........))))))....((((...))))))))))))))...((((((........))))))..))))...)))).....))).)))...))))))(((......)))))))))).))).))))).))))))(((((((....((...((((.(((((((.(((((((.....)))))))..(((((.........))))).((((.....))))....)))))))..))))....))...))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,((((((..((((((.((((....)))).)))...)))....)))))).,.....{(((((({.((((..(((((((.|||...,||{((,,,{,.((((((({{(((..{{(((((((..((((,......,.))))..))))).)).}}..))))))))))).,||}.},........))))}})..))))..{((((....))))}((((({.(((({.{{.,{{.((((((((.(((((,...,,|,|{,.....{({{....(((,.....{{{,....)}|.((((((((...((((((((((,.....(((((.....))))).((((((((.(((.....))).)))).)))){(((((((....{((((((((((((((((.(({.{{,(,,...,,.,}}|}))...{{.{{{....,(((,,((((((.(((((((({.((.(((((((((((({....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...,,,....{(((((,,(((((((...))))},,,.,}}..)))))}..,,((((..(((((..,...((((((((.((((((((..,{{{({....,})),,,.))))..)))}))))...))))...)))))..)}))..,.}},})))}}})))).)).}))}}})))).)))))))))}..,.}}}.}}(((((.{((({{..,,|...,(..,,||{.{||....||||||{..((({,{{(,,,,{{(|{{.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,..}))})),))))))}.|||}}}}}},,,|||||,||{},...{,((((((((((((...(((.(((((((((.....................,.,,,...{({((..,.{{,((({,..,...,||,,{.......,}})))})|,,.((((...))))......|||,,,..{((..((((((..(((....))).)))))).||}{{{{{{(,,((..,,)}..|}}|}}}..,||,.|(((((((.........)))))))|{.||,|.......,)))},)})}}}}}}}},..})))}})|||.,,.,{|{|||,|||,,,..}})))}|.}},,{{{....}},...,...))))))))))))...)))))},)))))),...,,,..}}}...)}})}|{|,{.,,}},))}}}}}}}}.))))))))))))))))))..)))}.(((((........))))).((((((.((((((.........))))))))))))..(((((((.....(((((((((.,,,((((,,,,.{((,(((({.{({((((,(({((((({(((((............,||||{||{|...((((.....))))...{(({{{(({,,{,{{{,(((({,(((..,(({{..,||.|||,..{{.{.(((((((,,,({{{...,))))...})))))).}.,.,{{{..{..,,..,..||}}..,,.||||.||,}|||.,{((((({(,..,,,,..||{{,.,||||,{|||.|||,.}||,,,.,..}}},.})))},.,|||}}{,|||||{{.,||)}|,,,}|||{.,,))}}..}}......{(({{...{.(((..(({...(((((((((..((......))..)))))))))...))}.))).|...}}}}}(((((((.{(((.|(((((((({......((((((..((((((.....((.(((((({(((((((((.......))))))))},|{{{...||},,|.,,.,.}|||.{(.(((((........))))).)},.....)))).)))).))..))))))...))))))..........)))))))))})))).))))))),..,,,)))}))))).||}||||{|,,,,},,))}||}.},.,{{,.,{,.,.||||}}}}}.,,},,......,....},,)))))}},...,,..|((((.(((((((({...})))).))))))))|,........,|||}||||}}}}}||{......,,}....,}}}}}}}))))}}}}|}}}}}}}}}}},}}))))},|..{,,..,||}..}},,,.....,,))).)}.)))...,))}}..))))))))).(((((.......)))))....)))))))..))))))))))))))))))...)).)))))).{(((((((((((((((....,,.((((((((...))))))))...,,...))))))....((({...})))}))))))))},..{(((((........))))))..})))...}))}.,..,}}}.}}}...))})))||,..,,,.)))))))))).))}.})))).))))))(((((((....((...((((.(((((((,{{{({,,{..{{|||||,...(((((.........))))).||||},.}},}},.))})))))))..))))....))...))))))).))))))))
Forensic Context

No forensic context available.