Basic Information

Symbol
hsa_chr20_0092600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0084
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
20:32978532-32978911 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34390726-34391105 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-120.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -125.90 kcal/mol
Frequency: 0.0001
Diversity: 43.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((..(((((((..((((........)))).)))))))........((((((((.(((((....((((((....((((((....))))))((((....((((((...)))))).))))))))))....))))))))))))).....((((....((((..((((((...))))))........((((((.(((((((((.(..((((....(((.((..(((((....))))))).))).....(((((...((....))...)))))))))..).))))))))).).))))).)))))))).((((.....)))).(((......))).........))))))...)(((((((((......)))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...,(((((.,(((((((..((((,.......)))).)))))))..,,.,,.((((((((.(((((....((((((,...((((((....)))))){(((....((((((...)))))).))))))))))....))))))))))))).....((((....((({..((((((...))))))........((((((.(((((((((.(..((((...,(((.((..(((((....))))))).))),....(((((...((....))...)))))))))..).))))))))).).))))).,))))))).((((.....)))).{{(......}))........}}}}},,.,,)(((((((((......))))}}))))
Forensic Context

No forensic context available.