Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0195
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:32980373-32996598 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34392567-34408792 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-429.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -460.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.