Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0117
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:32980539-33045279 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34392733-34457474 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-774.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -820.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 487.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((.((((((((((((((((((.((....(((.(((......((.....))........(((((((((((((((.(((((.....))))).)(((((..(((..((((....)))))))....))))).)))))).))))))))))).)))....)).))))))))))))))))))((((((...)))))).........(((((((......)))))))..........((((((((..(((..(((((....(((((.....)))))...)))))..))))))))))).(((((((.((((((((((((((((...))))).))))))............((((((..........))))))...............(((((((((..(((((.....((((((((........((.((((....(((((..(........)..))))).............((((((.(((((....((((.((((((((...((((.(.((((((.((((((((((((((((.((((.((..(((((((((((((((((((((((.((((.......(((((((((((((((.(((((((((((((.(((.((...((((.....)))).)).(((((((..((((((((.(((((.((...(((..((((((..........)))))))))....)).)))))..........((((((((......((((((.....(((((((((.....((((((..........((.((((......)))))).((((.((((((((((......))))...((.((((.....)))).)).(((...........)))..(((((((.((((((((((.......((((((((..((.((...........(((........)))..((((((((((((((.((((..((....(((.((((((((.((.....))))))))))..)))....))..))))...))))).))))))))))).))..))))))))......)))))))))).)))))))))))))))))...)))))).....))).)))))).))))))....))))))))..))))).)))(((((((......((((((((((((...((((((((((((...((.((((((............(((((....))))).)))))).))....(((.((.....))))).(((......))).....((((((..........(((((((((...(((((.....(((((((............)))))))...((((.(((((.((((.(((.....))).)))).))))).))))))))).))))).)))).)))))).................(((((((..(((((.....((((....)))).))))))))))))..)))..)))))))))...((((....(((((((...((......))...)))))))....)))).........)))))))))))).....))))))).....))))))))))..))))))))))))).)).)))))))))))))((((....(((.((....)))))))))(((.....))))))).)))))))))))))))))))))))..)).)))))))).)))))).))))))))(((..(((......))).)))(((........)))........)))).).))))....)))))))).))))(((((..(((((.((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................)))))).)))))..((((....))))((((((.(((....(((((((((((((((...(((.(((((((((................((((((.(((.(.(..(((((....(((........)))...........((((.(((....)))))))(((......(((....((((..((((((..(((....))).))))))...)))))))(((((.((((...((((((...))))))(((((((.........)))))))((.((((........)))))).)))))))))....)))..)))).)..).).))).))))))....(((((.....(((....))))))))..))))))))))))...))))).)))))))....)))..)))...))))))((((...))))....))))))))))))))))..........)))).))........))))))))..((((.((((..(((........)))..))))..))))(((((..((((((........))))))..))))).)))))..)))..)))))).......((((............))))))))).))))))))))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((({((((((((((((((((((.((....(((.(((.,,,..({,,...},.,...,},(((((((((((((((.(((((.....))))).)(((((..(((..((((....)))))))....))))).))))))})}))))))))).)))....)).))))))))))))))))))((((({...}))))).........(((((((......))))))).......,..((((((((..{{{..(((((....(((((.....)))))...)))))..}},)))))))).,((((((,((({((((((((((((...)))))},)))))}.......,(,{(((((({....,,,}}))))),(((((((((.,,{{,,{(({(,,({{{,.,.,,}}}}.....{({.({....}).}}||||,,(((((..{..,,},,,}.,)))}|{,...........((((((.(((((....((((.((((((((...((((.(.(((({{.(((((((((((((((((((((.((..(((((((((((((((((((((((.((((...{,..(((((((((((((((.(((((((((((((.(({.{{...,,{{.....,,}}.)).(((((((..((((((((.(((((.((,..(((..((((((.,,.....,,))))))})),.,.)).)))))..........((((((((......((((((,,,,,((((({(((,....||||{{.,........{{.((((......)))},,.{,,....|}{((((,.....})))}..,((,({{{.....)))),)}..{{....{{,,{{.,.,..(((((((.{(((((((({..,....{{((((((..((.((......,,.,.|||.......,)}}..{(((((((({((((.{(((,.(({.,.(((.((((((((.((,...,))))))))))..)))...}),,,)}))},.))))).))))))))))).))..))))))))......}))))))))}.))))))),,|,))))))..||},}}),},,.))).)))))}.))))))....))))))))..))))).)))(((((((......((((((((((((,..((((((((((((....{,((,,,,...,,,,.....{((((....}))},,)))}}},{{{{{,((({(({,....,,,}.(((......))).....((((((..........(((((((((...(((((,....(((((((.,,....,,...)))))))...,{{{.(((((.((((.(((.....))).)))).))))}.))})))))).)))))},))).)))))).{{{.{{,{,,......|||||||...,,.......((((....)))).,}))))))))))}.)))..)))))))))..,((((....(((((((...((......))...)))))))....)))).......,.}))))))))))).....))))))).....)))))))}))..))))))))))))).))}))))))))))))).,((({..,{{{({....,,}).,,.)))}...}}.,.)))).)))))))))))))))))))))))..)).)))))))).))))))})}))))}}(((..(((......))).))){((........)))........)))).).))))..,.)))))))).))))(((((.,(((((.((((((........((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).................)))))).))))},.((((....)))){(((((.(((....,{,((((((((((((...(((.(((((((((...................,.,.,,,...{((((..,.,{,((({,..,....||,,{......,,||)))})|,,.((((...)))).....,|||.,...{((..((((((..(((....))).)))))).||}{{{{{{(,,((.,,,|}..|}||}}}..,||,.|(((((((.........)))))))|{.||,{.......,))),,),))}}}|||}...})))}})|||.,..,{{{|||,|||,,,..}})))}|.}},,{{{....}},.......))))))))))))...)))))},)))))),...},}..))}...)))))}((((...))))....))))}))))))))))).{{{|{...{{{{{,({.,,......|{|||||{((((({.((((((.........))))))}))))))))}|}}}|}||..}}})),...,)))).)))))))))..,..,,.))},}})||}}||..,.{((((............)))))}))}.)}})))))))))))............
Forensic Context

No forensic context available.