Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0173
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:32980543-32981687 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34392737-34393881 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-351.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -375.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((((((((((((((((.((....(((.(((......((.....))........(((((((((((((((.(((((.....))))).)(((((..(((..((((....)))))))....))))).)))))).))))))))))).)))....)).))))))))))))))))))((((((...)))))).........(((((((......)))))))...........(((((((..(((..(((((....(((((.....)))))...)))))..))))))))))((((((((....))))))))(((((..(((((((((((.....(((....((((((((((...)).))))))))(((((((((((..((((((...(((....((((.((.(((((((......(((.....)))......))))))).))((((((.((((((.((((((.((..(((((((((((....((((...((((...(((((((....))))))).....)))).))))..)))))))..(((((((((((((((...(((((((.(((...)))...))))))).....)))))..))))...))))))................((((......(((((...)))))....))))..(((..((((((..........))))))))).))))..))))).))).))))))..)))))).(((.....))))))).....)))...)))))))))))))))))..((.((((......))))))..........(((((......)))))...((.((((.....)))).)).......)))...........((((((.((((((((((.......((((((((..((.((...........(((........)))..((((((((((((((.((((..((....(((.((((((((.((.....))))))))))..)))....))..))))...))))).))))))))))).))..))))))))......)))))))))).))))))(((((....(((.((....)))))....)))))..)))))))))))..)))))..((((.........))))(((........))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{(((,.((((((((((((((((((.((....(((.(((.,,,..({,,...},.,...,},(((((((((((((((.(((((.....))))).)(((((..(((..((((....)))))))....))))).))))))})}))))))))).)))....)).)))))))))))))))))),||||,,,,||||||.........,((((((......))))))|{{.,.,,,..{(((((((..,{,..(((((....(((((.....)))))...)))))..}},)))))))|{{{{{{{,,,,}}||||||(((((,.,{|||||{{||}}|,.|||....((((((((({...}),})))))))(((((((((((..((((((...,(({{,.((((.,{.((((((({{.{,.,{.,}.}})},..,,{{||,,,,)}))||{(((.((((((.(((((,{((..(((((((((((....((((...((((...(((((({....})))))).....)))).))))..)))))))}.(((((((((((((((...(((((((.,,{,,..,,,,.)))))))..,..))))}.,))))..,})))))...............,(((,,,,..,(((((...)))))..,.)})}|.|||,.((((({.||.....,.)))))}.)},})))..))))).))).))))))..)))}},.,,|,}}}}}.,))))....,)))}..)))))))))))))))))..{{.{({{......}))))),}},......{((((......)))))...((.((((.....)))).))..,,...}}}..........,((((((.{(((((((({.......((((((((..((.((,......,.,.{{{.......,))}..{(((((((((((((.{(((,.(({.,.(((.((((((((.((,...,))))))))))..)))...,),,,)})),,.))))).))))))))))).))..))))))))......}))))))))}.))))))|((((,.,.((,,((....)))))...,))))}{{|||||||}}}|,,||||{,.((((,......,.)))),,}}}}}.}}.}},,)))),)))
Forensic Context

No forensic context available.