Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0011700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0138407 hsa_circDENND4C_034 hsa-DENND4C_0010
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19298054-19328160 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19298056-19328162 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-269.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -293.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 380.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
................((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......((((((((.((((((.......((....)).......))))))....(((((...))))).........((((.............))))..........))))))))..((((.((((.((((........)))).)))).))))...((((((.........))))))........(((((.((((...(((.(..(((.((((((..(.(((....(((((((((......(((((....)))))...........((((((.....))))))....(((.((((((.(((((...........(((((..(((.(((.(((((((((...(((...((((((((....(((((((((((.((((........((((.....((((((((..(((((.(..(((((((.((..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)).)))))))..))))))...)))))))).....))))........))))))))))))))).....)))))).))...)))...))))..))))).))))))....))).)).....(((((...))))).....))))).....))).)))))).((((.((.(((...((((((..........))))))....))).)).))))..)))))))))....))))..))))))...((((((((((((((.....)))))))).........)))))).)))..).)))....)))).)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
({...,,{{,,,,,,,{((({{{{{{{{..,,.....,,..,,..{{({.{((((,,((((((((((((((.{({...,({((((({{{.,.{{{..((((((((.............(((({{{|{((({{{,.,.((((((...}))))).}....|||{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))..,...)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...}))))..,....||||||||,|}}||,,,.|.,..............||,........})))))))..}}}.}})))))).,......},,.}}}||||||,,,....}}}}}..})))).})})..}}...........}|||||.,||}}}},,,..,(((((({{.((((((.....,.((....)).......))))))....(((((...)))))......|..((((.,........||.)))),,........})))})))..{(((.((((.((((........)))).)))).))))..}||||||,..,,,,}|)))))},,|{{{..,{{{,|||||...|||}}}.|||.,||||||||}|||},,.|||{{{(((,....}||(((|..,||||||{||,,,....{({{{{.....)))))},,,,,{{{((,,{{.((((...........))))....|||{|||.{{,,,|||}},.,}}}}))}}||||,....{((((((((({.((((.,......((((.....((((((((..(((((.,..(((((((.,(,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).,),)))))))..})))))...)))))))).....)))).....,,.})))})))))))))}},}}}),,,...,,.,}}}}{{{{{,,,{{(((.(((((......)))))))).)))}.})))},}}}}}}}|||||}|,.|{{{||.,,,,|}}{{({.{({(((,..{(((({.,,,......,}))}},,,.}}},)).}}},..}))}},))},},.,}})}}))),}}...{||||({{({((({...,,|}}}})))..,,,,,..,}}}}|,|},...}})),.,,))}},)))}.......,)
Forensic Context

No forensic context available.