Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0003800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0138
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:32980543-33037285 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34392737-34449480 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-748.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -792.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((((((((((((((((.((....(((.(((......((.....))........(((((((((((((((.(((((.....))))).)(((((..(((..((((....)))))))....))))).)))))).))))))))))).)))....)).))))))))))))))))))((((((...)))))).........(((((((......)))))))..........((((((((..(((..(((((....(((((.....)))))...)))))..))))))))))).((((((((((((((((((((((((...))))).))))))).......))))))).((..(((....)))..))....((((........((((...(((((....)))))...(((((.((....)).)))))...(((((..(........)..))))).............((((((.(((((....((((.((((((((...((((.(.((((((.((((((((((((((((.((((.((..(((((((((((((((((((((((.((((.......(((((((((((((((.(((((((((((((.(((.((...((((.....)))).)).(((((((..((((((((.(((((.((...(((..((((((..........)))))))))....)).)))))..........((((((((......((((((.....(((((((((.....((((((..........((.((((......)))))).((((.((((((((((......))))...((.((((.....)))).)).(((...........)))..(((((((.((((((((((.......((((((((..((.((...........(((........)))..((((((((((((((.((((..((....(((.((((((((.((.....))))))))))..)))....))..))))...))))).))))))))))).))..))))))))......)))))))))).)))))))))))))))))...)))))).....))).)))))).))))))....))))))))..))))).)))(((((((......((((((((((((...((((((((((((...((.((((((............(((((....))))).)))))).))....(((.((.....))))).(((......))).....((((((..........(((((((((...(((((.....(((((((............)))))))...((((.(((((.((((.(((.....))).)))).))))).))))))))).))))).)))).)))))).................(((((((..(((((.....((((....)))).))))))))))))..)))..)))))))))...((((....(((((((...((......))...)))))))....)))).........)))))))))))).....))))))).....))))))))))..))))))))))))).)).)))))))))))))((((....(((.((....)))))))))(((.....))))))).)))))))))))))))))))))))..)).)))))))).)))))).))))))))(((..(((......))).)))(((........)))........)))).).))))....)))))))).))))(((((..(((((.((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................)))))).)))))..((((....))))((((((.(((....(((((((((((((((...(((.(((((((((................((((((.(((.(.(..(((((....(((........)))...........((((.(((....)))))))(((......(((....((((..((((((..(((....))).))))))...)))))))(((((.((((...((((((...))))))(((((((.........)))))))((.((((........)))))).)))))))))....)))..)))).)..).).))).))))))....(((((.....(((....))))))))..))))))))))))...))))).)))))))....)))..)))...))))))((((...))))....)))))))))))))))).))))........)))).......))))).....((((((.((((((.........))))))))))))))))(((...(((((........))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,..((((((((((((((((((.((....(((.(((.,,,..({,,...},.,...,},(((((((((((((((.(((((.....))))).)(((((..(((..((((....)))))))....))))).))))))})}))))))))).)))....)).))))))))))))))))))((((({...}))))).........{((((((......))))))}||,|......((((((((..{{{..(((((....(((((.....)))))...)))))..)},))))))))}((({{({{({({((((((((((((...)))))},)))))).......,|||||{{((..,,|...,)))}})}....{{({........((((,,,({{{,.,.,})}})....,{((.({....}).))|||{,{(((((..,..,,}}},}.})))}|{{...........((((((.(((((....((((.((((((((...((((.(.(((({{.(((((((((((((((((((((.((..(((((((((((((((((((((((.((((...{,..(((((((((((((((.(((((((((((((.(({.{{...,,{{.....,,}}.)).(((((((..((((((((.(((((.((,..(((..((((((.,,.....,,))))))})),.,.)).)))))..........((((((((......((((((,,,,,((((({(((,....||||{{.,........{{.((((......)))},,.{,,....|}{((((,.....})))}..,((,({{{.....)))),)}..{{....{{,,{{.,.,..(((((((.{(((((((({..,....{{((((((..((.((......,,.,.|||.......,)}}..{(((((((({((((.{(((,.(({.,.(((.((((((((.((,...,))))))))))..)))...}),,,)}))},.))))).))))))))))).))..))))))))......}))))))))}.))))))),,|,))))))..||},}}),},,.))).)))))}.))))))....))))))))..))))).)))(((((((......((((((((((((,..((((((((((((....{,((,,,,...,,,,.....{((((....}))},,)))}}},{{{{{,((({(({,....,,,}.(((......))).....((((((..........(((((((((...(((((,....(((((((.,,....,,...)))))))...,{{{.(((((.((((.(((.....))).)))).))))}.))})))))).)))))},))).)))))).{{{.{{,{,,......|||||||...,,.......((((....)))).,}))))))))))}.)))..)))))))))..,((((....(((((((...((......))...)))))))....)))).......,.}))))))))))).....))))))).....)))))))}))..))))))))))))).))}))))))))))))).,((({..,{{{({....,,}).,,.)))}...}}.,.)))).)))))))))))))))))))))))..)).)))))))).))))))})}))))}}(((..(((......))).))){((........)))........)))).).))))..,.)))))))).)))){((((.,(((((.((((((........((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).................)))))).))))},.((((....)))){(((((.(((....,{,((((((((((((...(((.(((((((((...................,.,.,,,...{((((..,.,{,((({,..,....||,,{......,,||)))})|,,.((((...)))).....,|||.,...{((..((((((..(((....))).)))))).||}{{{{{{(,,((.,,,|}..|}||}}}..,||,.|(((((((.........)))))))|{.||,{.......,))),,),))}}}|||}...})))}})|||.,..,{{{|||,|||,,,..}})))}|.}},,{{{....}},.......))))))))))))...)))))},)))))),...},}..))}...)))))}((((...))))....))))}))))))))))).))))....,...}}}}.........|{{,{(({(({(({.((((((.........))))))}))))))))))}|,||{{,,|..,},,..,}))))))
Forensic Context

No forensic context available.