Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0159
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:32981597-33045279 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34393791-34457474 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-405.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -430.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 388.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...((((((.((...(((.((((((((.(((..(((((((((..((((.........))))..))))).)).))..)))))))))))((((((((((((...................(((((....)))))((((((((............))))..)))).(((......))).......(((.....(((............)))...)))....(((((((............)))))))...((((.(((((.((((.(((.....))).)))).))))).))))))))))))))))(((((((((((..................((((((..(((((.....((((....)))).)))))))))))((..(((((((.((((....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...(((..((.(((..((((((......(((((((((.(((.........))).)))))))))....((((...(((((((.((((....)))).)).)))))....))))((((((((......((((..((((..........(((((((.(((..((((((((.(((((((.(((((.((((..((((...((((((((((((...((....((.(((((.(((....(((((((..((((((((......)))).((((((........((((((..(((((((...))).)))).))))))...((((((((........(((.(.....).))).......)))))))).................))))))....)))).))))))).....)))))))).))...))..))))))).((...(((.....)))....)).........................)))))..)))).(((........)))..........)))))))))...((((...)))).......)))))))(((..((((((..(((....))).)))))).)))(((((((..((....))..)))))))........(((((((.........)))))))((.((((........)))))).))))))))....))).)))))))....((((((((((.....))))))..)))).))))..))))........))))))))......(((((.....))))).......))))))..)))))..)))...)))).)))))))..))))))))))))).........(((((........)))))..((((.((((..(((........)))..))))..))))(((((..((((((........))))))..))))).)))..)).))))))((..((.((.(((((............))))).)).))..)))))))))((..(....)..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((..{({(({(|((,,.{{{.((((((({{(((..{{(((((((..((((,......,.))))..))))).)).}}..))))))))))}{(((((((((((...,{,.............{((((....|))}}{||{{{|{...,..,,{.|,}}},.,)))).(((......))).......{({.....{{{........,...}}),..}},....(((((((.,,....,,...)))))))....,,,.,{(((,((((.(((.....))).)))).)))))}),,,)))))))))))|(((((((((((.(({.{{,(,,...,,.,}}|}))...{{.{{{....,(((,,((((((.(((((((({.((.(((((((((((({....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...,,,....{(((((,,(((((((...))))},,,.,}}..}))))}...,((((..(((((.,,...((((((((.((((((((..,{{{({....}})),,,.))))..)))}))))...))))...)))))..)}))..,,}},})))}}})))).)).}))}}})))).)))))))))}..,.}}}.}}(((((.{((({{..,,|...,(..,,||{.{||....||||||{..((({,{{(,,,,{{(|{{.((((((,.......((((((..((((((,...,)).)))).))))))...((((((((........(((.{.....}.))).......)))))))).............,,..}))})),))))))}.|||}}}}}},,,|||||,||{},...{,((((((((((((...(((.(((((((((.....................,.,,,...{({((..,.{{,((({,..,...,||,,{.......,}})))})|,,.((((...))))......|||,,,..{((..((((((..(((....))).)))))).||}{((({{(,.((..,,}}..}}}}}}}..,||..|(((((((.........)))))))|{.||,{.......,)))},),))}}))))},..})))}))|||.,,.,{|{|||,|||,,,..}})))}|.}},,,{{....}},...,...))))))))))))...)))))},)))))),...,,,..}}}...)}})}|{|,{.,,}},))}}}}}}}}.)))))))))))))))),...{{{,,{{,,,.,,..,|||,{(({(({(({.((((((.........))))))}))))))))}|||||}}|{{{{{|{,,.,,|}}|}}}..,,,}}..))..)),}}})))|{..((.{{.(((((............))))).)).})..)))))))))((..{....}..))
Forensic Context

No forensic context available.