Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0006700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0023
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:32996457-33069011 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34408651-34481206 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-571.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -609.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 581.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.