Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0008900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0140
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:33001070-33001685 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34413264-34413879 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-113.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -127.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 186.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((...((((((((.............)))))))).....................(((((((.......(((((((..........)))))))....))))))).............(((((((((((.((((((.........((((.....)))).....((((((........((((...............)))).....))))))((..(((((((.......((((..((......))..))))...........(((((((.(((((.((((..........)))).))))).))))))).....)))))))..)))))))))))))))))))............))))))))).(((((.(((((((((......((((((.(((.(((((...))))).)))))))))......)))))))))..)))))...))((((((.(((........((((((((((..(((((.......))))).)))).))))))((((....((((....(((((((...((......))...)))))))....))))...)))).....((.((((.(((((...))))))))).)).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((((((((,,.((((((((.............))))))))........,,........,,.{((((({.......(((((({..........}))))))....}}}}|||,,,,.,,....|,|{((((({{{{{((((({.........((((.....}}}}..,,,,,|||,,,..,{{{(,{{..,{{{{{{,..,,.,.,,......)))))}},,||,.|||,......((((.,((......)),.)))).{(({{{(...(((((((.(((((.((({.{{....,)})))).))))).))))))).....)))))))..,,}))))))))))))))))....,,,.....})))))))).(((((.(((((((((......((((((((((.(((({...})))).)))))))))......)))))))))..)))))..,}}({{(((,{{(,,,..,,,(((({(((((..{{{((,......})))).))))||))))),||,,,,,((((....(((((((...((......))...)))))))....)))).||},,}...}}||,{{|{,{((((...))))}}))),},.)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.