Basic Information
Symbol
hsa_chr20_0093100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0064
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
20:33017035-33018934
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34429229-34431128
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-403.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-438.47 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
500.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((((....................((........))......(((.((((((((((..(((((((((.((((......(((((.....................)))))...))))..))))))).....((((((..((..(((((((((((...........(((..(((.(((..((((.(((((((((..(((((((...((....)).....))))).....(((.....)))........((((..................................((((((((((((......((((((...((......))..)).))))..))))))))).))).((((((((....))))))))....((((((....))))))((((.....))))..))))..((((((((((..(((.......((((((.((((((((((((((..(((......((.((((............))))...))......))).))).))))).....(((((.......)))))((((((.....))))))...((((((.((....((.((((((((..((....))..)))))))).)))).)))))).(((.(((.....))).)))..................................(((((((.((........)).)))))))............((((((....))))))..(((.......)))...............((((((.......))))))..)))))).))......))))......)))..))))))))))((......))..))..)))).))))).))))..))).))))))((((..(((((.((.((..........(((((.........(((((((((..............)))))))))((((((...........))))))...((((.((((((........)))..)))))))...(((((((((((((((((..........))))))))........((((............(((..(((((.........))))).))).))))(((((......)))))........((((((.((.......)).)))))).........(((((((...(((........)))..)))))))))))))))).....((((....)))).................((((((((((...(((.(((((((((((...(((((((((((....................)))))))))))................................................(((((((....)))))))........(((....))).......................(((((....)))))..(((((...(((((((....(((((.(((...........))).)))))....((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))...)))))))...))))).))))...))))))).))).......)))))))))).......)))))........)).)).)))))..)))).((((......(((((....)))))......)))).......(((((..(((.....((....))....)))))))).))))))....)))))..))..))))))(((((((((...))))).))))(.(((((....((((((..(((((.......)))))..))))))..))))).)...........(((((((((.............)))))))))...............))..)))))))))).))).......((((......(((.....)))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....)((((((.,..................((....,,..||......(((.((((((((((..{{(((((((.((((......((({{....................,})}}}...))}}..)))))))..,{,,((((({{,,...,{{|||,,,............,,,..(((.(((..((((.(((((((((..(((({{{...,,...,}}..,,,)}}}}.....{{{.....)))........{{{,..................................((((((((((((......((((((...{{......}}..)),})))..))))))))).))),((((((({....}))))))),...((((({....})))))((((.....))))..}}}}..((((((((((..(((.....{,{{{{((,((((({{(((((((..,,{,,,.,,,,.{{,,............|}||...}}...,||))|,}}}.)})))....,{{{||....{{{||}|}((((((.....)))))).,.((((((.((..{{({.((((((((..((....))..)))))))).)))).)))))).(((.(((.....))).)))..................,,......,,......{((((((.((........)).))))))}............((((((....))))))...}}}}}....|||....,,,........,{{{,,.......}})}}}..)))))).}}......})))......)))..))))))))))|{,,,...)},,))..)))).))))).))))..))).))),}|(((({,.{{({.,,.,|||,..........((({{.,,,,.{((((((({..............}))))))}}((((((...........))))))...((((.((({((........))}..)))))))...(((((((((({((((((,.,..,,|,,})))))}},.......((({.,,,......,,||{..{((({.........})))).....|||,(((((......)))))....}},.{{{{{{.{{.......)).)))})).........,{(((({...(((.....,}.}}}..}))))))})))))))}....,|||,.,..,},,...............,|||{{,.{,.,....}}}},)))))..|||},{((((((((((,...,.......,.......})))))))))}.,,...................,,{,..........,},,,.......(((((((....))))))).........,,....}}}............,......}}}}|||{{....))))}..}},,..,,}}}|}||||||{{{{{|.,,....{((((...((((((((((((((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))}.((((((((........,..)))},))))....,,{{{{,....,,,||||{((({,,((({,{{....}}.,}|||}|||,},|}||||||}|{{{..,,,,|||||,...)))))}}}}}.,)))},,,...(((({.{{((.....{{....)}....))))))))....,,,}}))))))))))))..)))))(((((((((...))))).)))),.{{{{{,..,{({{{{..{|{||.,...}.)))}}..))))})}}))))))),...,,,....(((((((((,............)))))))))..,},...,)),))))),,)))))))))).})),|,{,{{|{(({....,}}},},,.),)))..))).)))
Forensic Context
No forensic context available.