Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0018700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0050
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
20:33028985-33029485 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34441180-34441680 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-201.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -208.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 90.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((.(((((((((((((((((((.((((.(((((((((.((((((.....(((((((((.((((((.(((((....((((((((.((((((..(((((....)))))...)))))))))..............(((..(.(((((.((((((((((..((((....))))...)))))))))).))))).)..))).....)))))...))))).))).))).))))))))).....))))))))))))))).)))).))))))))))))))))))).))))..))))))))).))))))))))))))))))))))))(((.(((((....)))))((((((((......(((....)))......))))))))...............((((((((...))))))))....(((((((..((((.(((.((.......))))).)))).)))..))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((.(((((((((((((((((((.((((.((((((((,,((((((...,.(((((((((.(({,{{.{{{{{,,,,{((((({,{((((((,.,{{((....}}|||,.,|||||||,,.,............{{{..{.(((((.((((((((((,|({({....)))},}.)))))))))).))))).)..}},.,,,,))))),,,))))),))).))).))))))))).....))))))))))))))).)))).))))))))))))))))))).))))..))))))))).))))))))))))))))))))))))(((.(((((....)))))((((((((......(((....)))......)))))))).............{{((((((((...)))))))).,,.{(((.({.{((((.(({.((,.....,}}))).)))).}},,.))))..)))
Forensic Context

No forensic context available.