Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0019700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0087
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:33032296-33068097 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34444491-34480292 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-663.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -701.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(((.(((((((((((((.((((.(((.(((((((((((((((((((.....(((((((((((((((((.((((((.((((((((((((.(((((((((((.....((((((((((((.(((.....(((.((.(.(((((((...........))))))).).)).)))..((((((((.(((((.((((....(((.((....))))))))).)))))...((((...))))...(((((.....)))))...(((((((((((((.(((((.((((((.((.(((((((.....((((.((((((..((....))..))))))..))))......)))))))))((((((((..........))))....(((((((...((((((((....))))))))...)))))))(((((((((...))).)))))))))).......(((((..(((....))).)))))..........))))))))))).))))))..((((((((........((.((((...((((((....((((..(((.((((((((.(((..........(((((((((((((...((...))....)))))......(((((((...((((((..............))))))...))))))).................)))))))).))).)).))))))..))).)))))))))))))).))............)))))))).........((((((((((.....................)))))))))))))).)))..))).)))))..((((((((((.....))))))..))))))).))))))).)))))((((((..((((((((((((((.....((((((...(((((....((.(((((...)))))..((((....)))).(((.(((((..........(((((........))))).........))))).)))(((((((((..((((((.((((.(((((((((((((((.(((..((...........))..)))...))))...((.((.(((((............))))).)).))..((((.....))))..........(((......)))....(((..(((....))).))).)))).)).))).)).)))).))))))..))))))))).......((((..(......)..))))..((.((((.(((.(((...(((((.((........))....)))))..))).)))..)))))).....))....)))))....))))))))))))))).......))))).))))))...(((.(((((((((...(((..(((...(((((((((..((......))..)))))))))...))).)))(((..((((((((((((.((((..(((((((((......((((((..((((((.....((.((((((((((((((((.......))))))))..((((...((.....))...)))).((.(((((........))))).))......)))).)))).))..))))))...))))))..........))))))))).)))).)))))..(((((((((((.....))))))..))))).))))))).........(((((..(((((.....)))))...)))))(((((((((.(((...........))).))))))))))))..))))))))))))....))))))))))).)))))).((((((((...)))))))).(((.((((((.((((.(((((..((((((((((.(((.......(((......(((((.....)))))........))).......))))))))))))).((((.((.((..((((.(((((((((((...........((((((((......)))))))).)))))))))))))))..)).)).))))(((((((((.....))))).(((((((((...))).)))))).....))))....))))).)))))))))).)))............)))))).)))))).))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))).)))).))))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.............)(((.(((((((((((((.((((.(((.(((((((((((((((((((.....(((((((((((((((((.((((((.((((((,(((((({((((((((((,....((((((((((((.(((,....,.{.({({({{((((((((((......))))))}})})).))).}{(({((({.(((((.((((...,(((.,{....}})}})))).)))))...((((...))))...(((((.....)))))..{{((((({{{{{||.|||||.{{|||{|{{.(((({{|...{|{{{{.,,{{{,{,{{,,,|||||||,,,.{((|.....)))}}}}||||||{,,((((..........))}}....(((((((...,(((((((....)))))))}...))))))){(((({{{{...))}.)))))))}}},......(((((..(((....))).))))),{{,,,,,{,,}}|||}}}}|,|||}},..,,{|||||,....,,.,..{(({..,{,,,{{|,,.{{,,..,,|.||||||||.|,,..,,,.,,,,||||||,((((((...,{...,}....)))))}.....(((((((...((((((...,,.....,...))))))...)))))))........,,,.,,,,,))))))}),}},.,|||||}||{{|||,|||,}},,,,,,|{{||{,.......}|.}}||||||{{{....,}||{|||||||,,}},................,)))))))|)})))..})}})))},}}}}..{((({(((((.....))))))..))})))).))))))),,))))((((((..((((((((((((((.....((((((.{,(((((....((.(((((...)))))..((((....)))).(((.(((((...,,.....(((((........))))).....,,,.))))).)))(((((((((..((((((.((((.(({(({(((((((((.(((..((...........))..)))...)))),,,((.{(,((({(,,,,,.......,}}},.,,.,,..((((.....))))...,,.,,,,{{,......}}}....,||,.{{{....))),))),)))).})))),.)).)))).))))))..))))))))).......{(((..{......,..}}}}..,{.{{((,(((.(((...{((((.((........))....)))))..))).))).,)))},,.....))....))))).,}.))))))))))))))).......))))).))))))..,,,..,{{{(,.(({{.((((((((,..(((((((((..((......))..)))))))))..,|,|,.{{((,..((((((((((((.((((.{(((((((((......((((((..((((((.....((.(((((({(((((((((.......))))))))},||||...||},||,,}...,}||.((.(((((........))))).)},..,..}))).)))).))..))))))...))))))..........})))))))),)))).))))),,,{{,,((((({.....}))))}.,}}}},,)))))}).........,||||,,||||{,,,..))))),,.,,,.,(((((((((.(((.,......,..))).))))))))))))}.,})))))))))))}))),,},))))))))))))..((((((((...)))))))).(((.((((((.((((.(((((..((((((((((.(((,......{{{,.....(((((.....)))))....,,..}}).......))))))))))))).((((.((.{{..((((.(((((((((((...........((((((({......}))))))).)))))))))))))))..,}.)).)))){{{,,,{({...,,|||||.(((((((({...})).))))))....}))))....))))).)))))))))).))).....})))))})))))).)))))).))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))).)))).))))))))))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.