Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0020400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0186
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
20:33033315-33034657 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34445510-34446852 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -292.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 360.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((.((((((((....((((((.(((..(((((((((((((((...((((((((......))))))))(((.((((.(((....)))))))...)))((((((((..((((((((..((((..((((.(((((..((((((((......((.................))......))))))))..)))))..)))).))))((((((((....((.(((((((((((((.....(((((((..(((.(.((((.................)))).).)))..)))))))...(((((....).))))((((((((((.((................)).))))))))))......(((((((.....(((((((((.(((((((((((....((((((((..((((((..(((((.((...((((.((((....))))...))))...))..))))))))))).......((((.....)))).....))))))))..)))))))))))...((((((........))))))(((....))).....))).)))))).))))))).......))))))))....))))).)).....))))))))...........))))))))((((.((.((((((((((.(((.......(((......)))...(((((......)))))....))).)))))..))))).)).)))).(((((((...(((((((.....(((....((((...((((((....................))))))...))))..((((((.(((..........((((((......((((((((((((((......................((((((...........................))))))......................((((((.....))))))(((((((((((.........((((........((((((((.(((....))).)))................))))).......)))).............(((((...((((((.............))))))....)))))...)))).)))))))...(((.....))).......................))))))))))).)))........)))))).........))).)))))).....)))....)))))))))))))))))))))).))))))..)))))))))........(((((((.(((....))))))))))((((..(((.((((((.(((((....))))).)))))))))..))))...)))..)))))).)))))).))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,,{{{({(,,,,{,..}||||{(,(((..,{{{{{|||||{((({(((,((((((......)))))))},,.|((((,{{,....|||||}|.,,,})|||({(((({({(((((...((((..((((.(((((..((((((((......{{.................,,......))))))))..)))))..)))).))))......}))},.}}}..|||||{{,........(((((((..(((.{.((({....,............)))).}.)))..))))))).,.((((,....}.)))){(((((((((.,,..{{{{.........}))}))))))))))....,,({(((((,{,{{(((({{{{,.(((((((((((....((((((((..{(((({..{{{((.((,..{{{{,((((....}}}}.,,|}}}...}}..}}}}}}}}}}|.,,....{|||,....}}}}.,,..))))))))..)))))))))))...{(((((........)))))}(({....}))..,..})).)))))),))))}},...,{{{||||||,,,||{{{..{{{{{{{,{|,|{|,.....,.,,,..,,,,....)}}}}}}..))},,,,})}}}}})))}}}}}}}}},,,,{|((({(((((......)))))..,,........}}))))}},|||.,,},|||||||.,,||{{{{,....,|||,,,.((((,.,(((({,....(,,,.,,,{{...,,,||||||...}|||,{((((((.(((..........((((((......((((((((((((((......................((((((.{{......................,,))))))......................((((((.....))))))(((((((((((...,,.(((((.{,,........,....,.|||{{{{{...{{|......,}}.}}}},.........,,....((((((..........{{{,...,}}}..............))))))...,,,))))),}))))))))))))...{,{.....,}}.......................))))))))))).)))........)))))).........))).)))))).{,,,||}....,}}}}})))))),||||||||||}}}}}}..})}}}}}},.......,{{{{{{{.|||,,,,))))))))))|||{,}||{.{{||||,{{(((....))))),)}}}}}))))})))),..,,,..}}})))})),))).,...,}
Forensic Context

No forensic context available.