Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0023100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0086470 hsa_circDENND4C_050 hsa-DENND4C_0043
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19350700-19361961 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19350702-19361963 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-314.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -337.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 302.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
................(((((.(((.(...((((.((...(((((......(((((.((.......)).))))).....((..(((.((((.((((......).))).)))).)))..))....))))))))))).).))).)))))((((((((((.....))))))).)))......(((((((((...((((.((((((((...(((......(((((....)))))((.((((((((...........((.((((...)))))).((((.(((.((((((((.(.(((((((........(((((.(.((((((((((((....((((((((((((((......))))))((.(((((((((((.......(((....))).....)).))))))))).))....((((....)))).....(((((................)))))((((((((((((((.....(((..((((........))))..))).......(((((((...)))))))...............(((..(((....))).)))))))).)))))))))....(((((....(((((............)))))...))))).))))))))..)))))))))))).))))))....(((((((......((.(((((..(((((.((........))..)))))..))).)))).....)))))))........((((.(((((...))))).))))..))))))).))))))))).))).))))...((((.(((((..(((((..(((((...(((((...((((((((((..((((((((....))))))))..))).)))...))))............)))))...)))))......((((........)))).(((((((.......))))))).(((((((((.((((((..(((((...............))))).))))....))..)))))))))))))).))))).)))).((((((.((..(((...((((.(((...))).))))....)))..)).)))))).......(((((((((.((((......))))).....(((((((.((((((.................)))))).)))))))......)))))))).)))))))).))...)))...)))))))).)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,,.......(((((.(((.,...((({,((...(((((......{((((.((.......)).))))}.....((..(((.((((.((({......).})).)))).)))..))....})))})))}}}.},))).))))|((((((((((.....))))))).)))......{((((((((...((((.((((((((..((((,,,{{.(((((....))))),|.((((((((.{{{{{{{.{{{((((,({{.|,.....,,|}}..|})}}.,|||.,}||||||,,,.((.(((((((.(.((((((((((((....(((((((({(((((...,...{{{{{((.(((((((((((.,.{,..(({....))).,.}.))}})))))))).))....((({....})))...,{(({,,...,,,.......,,,|}}}}((((((((((((({.....(((..((((.,......))))..))).......{(((((,...|)))))},,.....,...,,.{(((.,({{....))).)))))))).)))))))))....,|||}....,{,(({.....}}}...)))))....)))))))))))))..)))))))))))).)))))},)).)),,,,......}||}||||{{,((((({,({{.,,.{{{{...,}))},||},,,...,,,|||}.....,,,((((((.(((.(((....{{((({{,.{{||{{|,,.,}}}}}))}.,}}.,))))))},..}}}.))))))))).,|||||}}},{{{{...((((((({((..((((((((....))))))))..})).)))...})))............})}}},,,})))),}.,,.(({{.,,,..}.}}}}.(((((((.......))))))),(((((((((.((((({..(((((...............))))).}}}}...,)}..))))))))))}}||,,||||.))}..{(((((.((..(((...((((.(({...})).))))....)))..)).)))))}.......|||{{(({{.{(((......))))},}},.(((((((.((((((.................)))))).)))))))......}}}}}}}}.}})},,},{||{...)))).}))))))).)))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.