Basic Information

Symbol
hsa_ITCH_0025400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0190
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
20:33058316-33069011 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34470511-34481206 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-108.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -119.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 107.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((.(((((((((..((((((((((((.((((.....((((..((((((.(((....))))))))).))))..))))..((((...))))...............((((((..........)))))))))))))))))).(((((.((((((........(((....)))...............(((((...((((((((((.((((((......)))))).((((((.....))))))(((...(((((.(((.(......(((((....(((........)))..)))))...).)))...)))))..))).(((((.(((((((((...))))).))))))))).........((((.((((.....(((......))).....)))))))))))))))))).))))))))))).))))).......(((((.(((...))).)))))...)))))))))..))))))).)(..(((((((...................))))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((((.(((((((((..((((((((((((.((((.....{{{(,.(((((,{(((....))))))))).}}}}..)}}}..((((...))))..,|...........,{{{{{..........}})))))))))))))))).(((((.((((((........{{(....}}}...............(((((...((((((((((,({{(((,,,,,,|||||,.((((({.....}))))){((.,.(((((,{{((,,..{{,({(((.,.,(((........)))..}}}}}....,}.}}}})))}}..))}.,{(((.(((({((({...})))}.}))))))||{........||||.{{{{.,,,,|||,,.,,,))).,,,,)}})),,,)))))))))).))))))))))).))))).......{((({.,,,....}}.}))))..,)))))))))..))))))).)(..(((((((.,...............,.))))))).....)
Forensic Context

No forensic context available.