Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0010100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0150
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107602560-107624081 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104840279-104861800 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-187.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -199.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 151.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.