Basic Information
Symbol
hsa_ITCH_0030900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ITCH_0120
Host gene
ITCH
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
20:33091033-33092013
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:34503228-34504208
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-226.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-248.94 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
283.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.(((....(((((..((((.((((...)))).))))...)))))..)))..)))))...((((((............(((((.((((((....(((.....)))........))))))..)))))(((((((...((((.....((((((....))))))..)))))))))))...(((......)))...........))))))(((((((.........))))))).......(((((((.(((....))))))))))(((((.(((((((............))))))).)).)))............)(((..(((((((((((((.............(((((((..(((((((.(...........)))))))))))))))((((((((.(.(((((((.(.(((((............((((((...))))))...((....(((((((.((......)))))))))..))(((((((((................)))).)))))........)))))))))).)))).))))))))(((..((((.....)))).)))..(((((..(((((..((............))..))))).)))))(((((((((............((((.............(((((..........)))))..((.((((((((((..((((((((((((.(((((((.(((..((((((((..((((.......))))..))))))))............(((((....)))))..(((((((.((((((.((..((((.......))))..)).)))))).))))))).(((.((((((((..((..........))..)))))))).))).....(((....))).)))))))...))))))))...)).)))))...))))).))))))))))).....))))))))).....)))))))))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{(((({((({{..,,|||,,||||}|{||..,|}}}.))}},,,|||||..,,.,,}}}}}||{{(({{,............,((((.((((((....(({.....}}}........})))))..))))}(((((({..,((((.....((((((....)))))),.))))))))))).,.{{(,,,,..,}}.|,|}}},..,}})))|{((((((.........)))))))}.,}},,{((((({{(((....))))))))))(((({.(((((((............))))))).}).)))............,(((..(((((((((((((.,...........{((((({..(((((((.{...........,)))))))})))))|((((((((.(.(((((({,(,(((((,,.........,((({{,..,}))))}...||,...{((((((.{(......)})))))))..,,{((((((({,{{{.........})}))))},)))}........)}}}}})))).)))},))))))))|....((((.....)))),{{{{{(((((..(((((..({............))..))))).))))}.,,||||||,..........,||||,,........,||||.,........,,,||||.,{(({((((((({({..{{{|||||||(({((,(((({({,..((((((((..((((.......))))..))))))))......,,{{({(((((....))))),,}|,|}}}.|,,|{{,...,)))|,.,}}},||||,{{{,{|||,,.,,||||,.(((.(((((({{,,((..........)).})))))))).)))}}}}..,|,,,,})),))))}}},,,}}}})))),,,)}.}))))...))))).}})))))},,,...,.}}}}}})},...,.)))))))))))))..)))
Forensic Context
No forensic context available.