Basic Information

Symbol
hsa_KLHL1_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100790 hsa_circKLHL1_015 hsa-KLHL1_0002
Host gene
KLHL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:70370870-70456627 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:69796738-69882495 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-148.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -160.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((..(((..(((((((....(((..(((((...((((((......))))))......)))))..)))....))))))).)))))))))(((..(((((.....)))))..((((((.((..(((..((((....))))..)))..)).))))))..((((...(((..(((((.((((((((.......((.((((((...((((((((.(((..(((((((((...((((.............)))))))))...))))((((.(..((((....((((((..........)))))).....))))..))))).(((((((((((((........................)))).)))))))))..(((((......((........))......))))).((.((((.........))))))..)))))))))))....))))))))...))))).))))))))..))).((((((((((((.((((((..((((...((((........)))))))).)))))).....((((((.(((...))).))))))..............((((((.....)))))).........))).)))).)))))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((..(((..(((((((....(((..(((((...((((((......))))))......)))))..)))....))))))).)))))))))(((..(((((.....))))){{((((((.((..(((..((((....))))..)))..)).)))))}.}|,,{...(((.,(((({{((((((((.......((.((((((...((((((((.((({({,,,{((({...((({,{.,,,,....,,}))}}||||{,,}||,...}}))))}}}}},.((((((,.......},}))))),,,{{{{.....}}}}.(((((((((((((........................)))),,))))))))..(((((......((........)}......))))}.|{.|||{......,..)))},}..}},))))))))....))))))))...))))).)))))))),,))).{{{(((({(((,.((((((..({((...((((........)))))))).)))))).....((((((.(((...))).))))))......}},..,},{{((({.....)))))}.,,{||||{{{|..,,,.,,)))}}))),)))
Forensic Context

No forensic context available.