Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0010300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0106
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107604495-107605392 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104842214-104843111 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-253.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -271.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 263.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.(((((((((..(((.(((.(((.......(((((...((((.........))))...)))))...)))))).)))....))))))))).).(((((..(((((((...(((((((((((.........((((....))))..........)))))))...).)))..........((((..(((((((.(((........)))..(((((((((((((...(((((........)))))..)))))...)))))))).(.((.(((....))))).)(((.(((((.((((((((((((.((...((((((((((.((((...)))).))))))((((((..((((.(((.((.((((..............((.((((......)))).))(((((..(((((((((.((((((...((((((((..(((..(((.....((.....(((((((.((((((..........)))))).((.(((((.((((((...((((((((((..(((((((.((((((((.(.((......((((((.(((....(((..((..(((((...((...((((...((((......)).))...))))))...))))).))..)))....)))..))))))......)).).)))))))).)))))))........)))))))))))))))).))))).))))))))).....))...)))...))).))))))))..)))))).)))))).)))...)))))))))..)).))))))).))))))...((((......)))))))).)))))))))))))).((((((((...)))))))).......................))))).))).)))))))...)))).))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{.(((((((((..(((.(((.(({......,(((((,,.((((.........))))...))))}|..}}}))).)))....))))))))).}.(((((..{((((((.,.{((((..,.,,......,,..|||},,,{{{|.{{...}}..}))}))}...{{{{{{{{...{{{,((({,,{(({(((.,,,,...{{.{((({.,,(,,,,{|.,{|,|||{||.......}}),)).,,|||||{{,|||||(((((((.........)))))))||,,||(({.{{{{{|{{{(({.,,.,.||||||||||,|{{|,,,)))),})))))}||((({{((((,(,{,{(,({{(((.{{{{{{...{{(({((,,.,{,,,|}||.||{{{{{.,{{.((((((.((((((...((((((((..(((..(((.....{{,,...(((((((,((((((..........)))))).,(.(((((.((((((,..{(((((((((.,(((((((.((((((((.{{((,.{...((((((.(((....{{{..,,..(((({,||{(,..|{{|..,|{{(......}}|||...}})))}...}))))..,..})}....)))..))))))..,.}}}}.}.}))))))).)))))))....,,,,)))))))))))))))).))))).))))))))).,}..,},..)))...))).))))))))..)))))).)))))).)))...,}}}))))).})},)))),,,.,,}},}...((((......)))).)))))))}))))))}))).{(((((((...)))))))}..............,{{{......)))),))).})))))),,,)}}).))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.