Basic Information

Symbol
hsa_CDKN2B-AS1_0005700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0086590 hsa_circCDKN2B-AS_011
Host gene
CDKN2B-AS1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:22056251-22064017 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:22056252-22064018 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-248.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -268.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 252.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((..(((((..(((...)))..))))).)))))..)((((...(((.((((((((((.((....)).(((((......))))).....((((((......)))))).))))))).((((((..........)))))).........((((((.((..........))))))))...))).)))............(((.....))).(((((((......((((((...))))))((((((........))))))..)))))))....(((((((((((((((((((......))))))......((((((..((((.....(((..(((((((.....((.((.(((.((........))))).)).))...)))))))....)))))))))))))....(((((........((......((((.....((((((..((....((((.....))))((.((((......)))))).....))..))))))...))))......))........)))))......(((((..((.(((((........(((....(((((((......((((((....))))))...))))).)))))((((((...)))))).((((((..(((((((.....)).)))))..))))))..))))).))..))))).)))))))))))))...((...))((((((......))))))..(((((((..(((((((........).)))))).((((((.........)))))).......(((((...((((...((((.((...)).)))))))).))))).............(((((.....)))))........................)))))))...............(((((((.(((((((.((..(((..........))).))...((((.(((......))).)))).))))))))))))))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.({({(,((((((,.{{,.,,|||..|||}},)}|}}..}{(({,,.,{({,{,(((((((.((....)).(((((......))))).....((((((......)))))).))))))).|{|||,.,,..,.,}|}))}|||,,,,...,((((((,({........,,}})))))).,.,.{,((({...........(({.....))).(((((((......((((({...})))))((((((........))))))..)))))))....(((((((((((((((((((......)))))),.....((((((..{(((.....{{{..(((((((.....((.((.((,{((........))))).)).))...)))))))....}}})))))))))).......,{{{....,|||,.,...((({.....((((((..((,...((((,...,)))),,.{||{{{{,..,,}},,....,)),,))))))..{||||.....}}}||.,,||..}}|,,,,,,,|{{{|..{{.{{{{{.......|(({....||||{{{......((((({....})))))...))))).}}}}}((((((...)))))).{(((((..(((((((.....)).)))))..)))))),.))))}.))..}}}}},})))))))))))}.,.{{...,,((((((......)))))){{{{,{{|,..,{,{{{|.,,.,...},))}}}},{{((({........,)))))}.......|||||,,,||||,,,{|||.{,...,}.)))).||,|))))}......,}},{{,(((((.....))))).}},....,}}},}}}.,,.....|||,,.................(((((((.(((((((.,{..(((..........))).},...((((.(((,....,))).)))).))))))))))))))....))))
Forensic Context

No forensic context available.