Basic Information

Symbol
hsa_LIN54_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0127103 hsa_circLIN54_007 hsa-LIN54_0011
Host gene
LIN54
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:83852096-83900159 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:82930943-82979006 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-316.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -343.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((..((((((((((((.(((..(((((.(((........((.(((((..((((((..............))))))..((..((((((((.....................((((.((.((((.(((((((((((..((((......((....)).....))))............))))))(((((((..((.....................))..))))))).........((.((.(((....))).)).)).......(((((((.....(((((((.......(((((........)))))......)))))))..((((((((......((((((.((((........(((((((........)).))))).(((((((...........)))))))(((((.(......).)))))(((......)))..(((.((.(((..(..(((......)))..)..)))...)).))).......(.((((((....)))))).)...)))).))))))....))))))))..(((..(((((.(....((((((..................))))))......((((....))))).)))))..)))...(((.......)))........)))))))........))))).)))))).)))).((((....))))))))))))..))))))).))))).)))))..)).).))).)).)).))))).)))...((((.((((((((((...(((.((((((.((((((((((..............((....((((....(((((...))))).))))....))(((((.(((...(((....((...(((((((((((((((((((.......))).((((....))))...((((.((((((.......((((.((((((..(((((((........)))))))....((((((((((((..((((((..((.........(((....))).((((((....((.......)).))))))((((((..(((.....(((((...(((......))).....)))))..)))...)))).))...))..))))))..))))))))))))..)))))).))))......)))).)).)))).((((((((((...............)))).))).)))...).)))))))).....))))))).))..)))..))).)))))..)))))))))).))).))))))))))).)))))..)))).((........))(((.(((.(((((((.........)))))).).))))))......(((..(((.(........).)))..))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((....)))......((((......{{{(((({((,....{,(((((..{,(((({,,,...,,,....|||||||||||{{{{,{{{{,........||||{{,{((((({,{{{{.{((({((((((({.,..,{{{{..,...{{,.,,}}.....|}}},....,,.,|,|||..,||||||||.||||||||.,,,.....,{,.......,},..............{{.,{,(({,..,|||..|.{{{......|||,{{|,..,,||{{|||.,,....{{{{(,,,,,..,||}||,....,}}}||}|..((((({{{.....{(((((({((({,.......(((((((........))}})))),(((((((.,,....}...)))))))(((((.{......).))))){{{......})},}|||.||}|||.....,({......,}}..{{,,|,...||..||...||,.{.((((((....)))))),,.,|}}||{||||.|,|||||||||}},,((,..{||||......|{((((.,.,,,............,,}}},......{(((....}}}}|.,}||}..,}}...(((.......))},},..,,,}}}}|||.}}}}|,|,{{..{{{,.{{{...,{((((....)))}(((((((((........)))))},))))),.,))))))}.,|}||{{{{...((((.((({...)))).))))..}))|,|,..||||,{,..,,{,.,||||,}}}}}}}}}}...((((....(((((...))))).}}}}(({.(((((,,((((.((((.......))))..)))).((((....))))..}.}}))).})}....,,,,...,,.}}})})}}))},))))),}))))))))))}})).,.}}}}...,))))})}....||||{{({|||||,||||,,..}))}}},|||||{{........((((((....((.......)).))))))((((((..(((.....(((((...((({...}})).,,,}},,,}}..)))...)))).))|,|}||,|,|||..,}}||},,}||||..|},,.,),.)))}}},,..,,,}))})}..||||},}}})},......,|||}||}}|},,,{||},..,}},||(((({{,{{,,.{{{{{,,..,,,,..{,.||||,{||,|||.{{{{(({,,.}}})))}{(({..{{...{{{...||........}),))}...,}||,}}}.}}}}.}}..,))))))},)),)))})}.))))},..{||}||,,....)}))),))))....
Forensic Context

No forensic context available.