Basic Information

Symbol
hsa_LIN54_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LIN54_0051
Host gene
LIN54
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
4:83859710-83860691 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:82938557-82939538 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-201.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 275.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((((..(((((.(((((.(((((...(((..(((((((((.....((((((..(((((.(((((((.(((((((((((.........(((....)))..(((......)))....((((((..(((......))).))))))..(((((((((((.......)))..))))))))....(((.((..(((((((((((((......)))))((((((....)))))).(((((((.(.(((..(((.(.((.((((((((((.((((.((((........(((((.((((.................)))).).)))).......((((((.((((((......(((((((.....(((((((.........)))))))....)))))))........))))))........(((.(((((((...(((((.((((..............)))).(((((......))))).(((........)))....(((((.((((....))))))))).)))))..))))))).)))....(((((((((((((...))))....)))))))))((((((((...))))))))((((((((((((.(((((........))))).))))).))))))).......(((((((((((.((..((.(((((..((((...((.(((((((.......))))))).))))))))))).))..))....))))...)))))))......)))))).))))))))...))).)))))))))).)))..)))..).)))))))((((...))))..))))))))..)).)))((((((((((((((.......))))).....))))))))).)))))))).........)))))))))))))))..........)))))))))))))))......)))....)))))))))).))))).))))))))((.(((.......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...(((({.,(({,,.{(({{,,,,,{.,,{{{..(((((((((,,,,.{({{,(..(((((.((((((,,(((((((((((.,......,{({....}}},||{{......}},....((((((..(((......))).))))))..(((((((({((.......)}),.))))))))....{((.((..(((((((({((({..,...}}))){(((((....)))))}.(((((((.{.(((..(((.(.({.((((((({((,((((.((({..,.....(((((.((((....,............)))).)}}))),,.....((((({..,,,{,,,,...,.,|{{{{,,.,,(((((((({.....{,{|(((((((((......))))))))),}).}.....})))))))),|....,|.,,,,.|||,.....,,,..,,,||||||{|,{{{,,{{{||,,|,(((,.......)))....(((((.((({....)))})))))..}}|{({((,,,.,{||{((..((((((((({{{{...,}}}....))))))))).,}))}}....,)))))}{(((((({(((((.(((((........))))).))))).}))))))),,}}}}||||{{|||||.||,}||.,,|||,,||||}.,||.(((((((.......))))))).}}}})))}}},.,,..}}....,,}}}}}},,,}}}.,,..,)))))).))))))))...))).)))))))}}).})),.)))..}.))))))){|{....,,,}..))))))))..)).))}{(((((((({{(((.......}}}}}.....}))))))))})))))))).........)))))))))))))))..}....,,,)},,,,)))))))))..,,,..,|,,,,,}}})))))},}}},,.})))})))((.(((.......)))))
Forensic Context

No forensic context available.