Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0010500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0060
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107607007-107607757 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104844726-104845476 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-191.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -207.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 167.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(..(((((.((((.((((.((((((((..(((......((((...))))...))).)))))).)))))).))))....((((.((((((((((((......)))))....)))))))..)))).....((((.(((.........((((((.((((.((((((...)))))).))))..))))))...........(((((((((..(((.(((((((....((((((....)))))).(((...((((((.(((((.....(((((....)))))............)))))))))))...)))..))))))).)))...(((((((((((..(((((.....(((.((((((((...((((((.(((..............(((((.........((((........)))).......))))).........(((..(((((....)))))...)))))).))))))..))).))))))))..))))).((((((....))))))..((((..((((..(((((((((((........))))..(((((....))))).............))))))).))))))))))))))))))))))))))))...((((.((((..........((((.((...(((.(((((...........))))).))))).)))).)))).))))(((((((..((.(((....))).))..))))))).)))))))..)))))..).((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{,((((((((((.((((.((((((((..(((...,..((((...)))).,.}}}.)))))).)))))).)))|.{{,{({{(((((({,,(((||,,,..})))).|||||}}||||,}}||.,,,,{|{{,||{{{{{....,||||,,,{{{{,||||{|..,)))))).}}}}.,,},}}}.....,..,,.(((((((((..(((.(((((((....{(((((....)))))).{((...{(((((.{{({,,,,,,(((((....))))}...,,,....),)))))))))))...}}}..))))))).)))...(((((((((((..(((((.....(((.((((({({...((((((.(((.{({,.........{{{{{.........((((........))))......,))))}.........,{{||(((((....)))))...,,}))).))))))..}}).))))))))..))))).((((((....}}))))..||{..{((((..((((((({(((........)))}..(((((....))))),,....,,.,},.))))))).)))))}},))))))))))))))))))))...((((.((((...........,,{{({,.,(((.(((((.,,.....,..))))).)))}).})))})))).))))(((((((..((.(((....))).))..))))))),|,..}}}..,,.})}}},}},,.....,
Forensic Context

No forensic context available.