Basic Information

Symbol
hsa_LIN54_0003900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LIN54_0071
Host gene
LIN54
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
4:83867411-83902628 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:82946258-82981475 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-724.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -783.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 702.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

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