Basic Information

Symbol
hsa_LMTK2_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LMTK2_0020
Host gene
LMTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:97820961-97823884 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:98191649-98194572 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-997.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1045.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 498.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((.....(((((..(((.(((.....(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).)))))))....))))))..)))))........((((((((....)))......)))))...(((..(((((((.(((....(((.((((((((((((((..((...(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((........(((((((.((((..((....(((((((.(((((((((((((((...((((((....))))).)....))))))).....((..((((((((.(((((....((..((((((((....))))))))..))....))))).)).))))))....)).(((((..(.(((.....))).)))))).((((.((........))...))))....((((((.((((.............))))..))))))...)))))))).))........)))))....))..)))))).)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....))))(((.(((.((....)).))).))).)))))))))))))))...))(((.((.((((..................)))).)))))((((..(((((((((..((((....))))...(((((.(((..((((.(((.((((((....)))))).)))))))...))).))))).(((((..(((........((.((((((((.((.((((((........)))))).))..))))))))..)))))..)))))..........)))))))..((.(((((.(((((..((...(((((.((((((((((((.((((.....))))..(((((.......)))))..(((((((...((((....)))).....))))))).........((((((...))))))...........))))))))))))(((((((((.((......)).)))((((.((...........))))))....(((((((((..((.......(((.((.(((...))).)))))))..))))))))))))))))))))..))..))))).))))).))...))...))))..((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......)))))..)))))))).((((......))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((...(((((((.......)))))))....)))....))))))))))))....)))))).)).).....))))))))))..)))....(((.((((((.(((((((((((.(.(((((.((..(..((((((((...(((((((((.(((...((...((((.((((((.(((....................))).)))))).))))..))))).)))))..(((((((........))))..(((((((.(.((((((..((((((...........(((((............(((((((.((.(.((((...(((..(((..((..((((((.....)))))).))....((((((.(((.((.((((..((((((((.(((((((((..(((((((((((....))))).(((((.((((..((((.(((...)).).)))).)))).)).)))(((((((..(((....(((..((((..(((((((((((((((((......(((.....)))(((((((((((((((..........))))))....)))......)))))).......(((......)))((.(((((((.....)).))))))).......))))))))))........)))))))((..(((.(((.(((((....))).)).))).)))..))....(((((((((((((((........))))))).(..((((((((((.....(((.......))).....))))))))))..).((((..((((..........(((((((.((((.(((((..((.(......).))......(((((((((...((((((.....)))))).)))...(((((((.((...........(((((((...)))))))(((((((((((((.((((((.((((((.........(((.(((((..(...((((...((((......))))...))))...)..)))....)).))))))..))).))))))))))).))).))))).....((((.((((((...(((........)))..)))))).))))...)).)))))))))))))..............))))))))).)))))))...((.((((((((......))))))))))....)))).))))........))))))))..))))..))).)))..)))))))....)))))).)))))))))........))))))))..)))).)).))).)))))))))..))).........((((((((((((((...((((((.......))))))...)))).).))))))))))))).))).))))))).....(((((..((.(((((......))))).))..))))))))))))).)))))))))))))))))(((....))).))).....)))).)))))).))..)..))...))))).).))))))...))))).))).))).))).....)).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,.({,....(((((..(((.(((..,..(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).))))))).,..))))))..)))))........((((((((....}))......)))))...{((..(((((((.(((....{((.((((((((((((((.,{,...(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((.{,,{.,,(((({,(,{(((,.((,..,(((({((.((((((({(((((((...((((((....))))).)....))))))).....({..((((((((.(((((.,..((..((((((((....))))))))..)).,}.))))).)).))))))....}).(((((..{.(((.....))).}))))).||{{,|{..,,,...},.},)))}....{(((({,((((.............}))),.}))))}...}))))))).))..,,}}}.))))}....)),.))))}),)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....)))){((.(((.((....)).))).)),.)))))))))))))))..,},{{{.{{.{{{(.,,{,,....,|||....||||.|||,},{{{..{,(((((((..((((....))))...,{{((.(({..((((.{((.((((((....)))))),))}))))...,},.}))),.(((((..(((........((.((((((((.(({{{{{({........)))))))),..))))))))..)))))..)))))..........)))))))..{{.{{{{{.{{{||,,{{,,,,,,,,.((((((((((((.{{((,....}}}}...}}},,.}......(((((((((((..{{{...,}).)))))))))))),{{,.........{{(({,...))))},...........))))))))))))(((((((((.(,......}}.}}}|,{{.,{,,,||..,,..},}}))}}},(((((((((..((.......{((.,,.{{{...,}),}}})}))..)))))))))})))))..,,,.,}}..))))),))))),}}|,.}}...}}))..((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......)))))..)))))))).((((......))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((,..(((((((.......)))))))..}.)))....))))))))))))....)))))).)).}.....))))))))))..)))|.,.{((.((((((.(((((((((((.(.(((((.((..(..((((((((...(((((((((.(({.{{{,...((((.((((((.(((....................))).)))))).))))..)}}}}.})}}},.{{{({,(,,.....,)),,..(((((((.(.((((((..((((((...,,......(((((........,,.,(((((((.((.{.((((,,,(((..(((..((..{(((((.....)))))).)}....((((((.(((.((.((((..((((((((.(((((((((..((((((({.(({..(((((((((((.{((,......}}})))))}}}))))..})),}.,.....(((((((..{{{..,.(((..((((..(((((((((((((((((........({{..,{{{(,(((({,,((((((..........))))))..},))}}.}}|,|||}}}.......{{{.,..,,||,{..(((((((.....))}))))),},...,,,))))))))))........)))))))((..(((.(((.(((((....))).)).))).)))..))...,(((((((((((((((,.....,,))))))).(..((((((((((..,..(((.......))).....))))))))))..).((((..((((.......,..(((((((.((((.(((((..((.,......}.)}..,,..(((((((((...((((((.....)))))).)))...(((((((.((..,{,{..,,.(((((({...})))))){|||||||((((,,((((((.(((((((..,.....,((.,{({({.{...((((...((((......)))),..))))...|..}))....}),}}))))..))).))))))))))).,,,.}))}}.....((((.((((((...(((........)))..)))))).))))...)).)))))))))))))..............))))))))).)))))))...{{.((((((((......))))))))}}....)))).))))........)))))))).,))))..))).}))..)))))))....)))))).)))))))))........))))))))..)))).)).))).)))))))))..}},.........(((((((((,((((...((((((.......))))))...)))).,.))))))))))))).})).))))))).....(((((..((.(((((......))))).}),.))))))))))))).)))))))))))))))))(((....))).}},.....)))).)))))).))..)..})...})))).).))))))...))))).))).))).)))))}..||{,,,...}}}
Forensic Context

No forensic context available.