Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0073300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LPAR1_0048
Host gene
LPAR1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:113677604-113679558 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:110915324-110917278 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-500.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -537.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 440.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((.(((..(((((..................((((((((((.((((...........))))..)))))))).))....(((((((.....(((((........)))))..(((((((.(((((((((..((((((((..((((((((((((..(((((((.((.........)))))))))))))).)))((((((((((((...))))))))))))....((((((...........(((((((.(((.((((.(((((...((((((((...(((.(((((((......))))))).)))...(((((....(((((((((((....)))))))))))....)))))((((...((((((.....(((((..((((..((((.((((.....))))))))..))))..))))).....)))))).))))))))))))...)))))..)))).))).))))))).....((((.........))))..................((((((((....(((.....)))....))))))))..)))))).)))).))).))))))))).)))))..))))))).......((((((((..((((...(((((...)))))...))))..)).))))))............))))))).(((((.((((...(((((....)))))........(((((((.((((((.(...........))))))).))))))).............)))).))))).......(((((((.((((....))))))))))).....((((....))))...((((((((...(((((((...))))))).(((((.((((((....(((((((((((((((....................)))))))).((((...)))).))))))).......)))))).)))))...........(((.(((......))).))))))))))))))))..))).)))))..(((((((((((((..(((((...((((((..(((.....((((((..((((.((((............(((.(((((((((((..(((((((((((((.(((.((((((((.((..(((....)))..)).))))))))...))).........((.(((..(((((.((((((((((((........)))))..))))))).....)))))..)))))((((..((((.((((.((.....)).)))).))))..)).)).(((...))).))))))))))))).......((((....)))))).)))))))))..))))))).)))).))))))...)))))))))))))).....))))).(((.(((..(((((((.....((((((.....((((((....))).))).................))))))......)))))))..))).))).............))))))))..((((.((((((....((((((((........))))))))......((((((((((((....((((..(((((.....((((((.....))))))....((((((....................)))))).)))))..))))......))))))))))))..............)))))).))))(((((..........)))))..........(((((((......................))))))).(((((((((........))))))..))).((((((((...(((((.(((.(((.((.(.((((....)))).).))...))).))))))))..)))))))).))(((......................................((((((((......))))))))....(((((((........)))))))..(((..((.....))..)))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..{(.(((((...}}}}}}}.,}{..,.,{({(,....,,,,||||}||,...{((((..(((((((,.((((((((((({{.((((((({{{((((((({{{{(...{,,(({((((((((.(((((((((..((((((({..,(({{(((((((..(((((((.((.........)))))))))))))}.))|((((((((((((...)))))))))))),...{(((((...........{((((((.(((.((((.(((((...((((((({..,(((.(((((((......))))))).))}{,,{{{{|....(((((((((((....)))))))))))....}}}}|((((...((((((.....(((((..((((..((({,((((.....))))))))..))))..))))).....)))))).))))))))))))...)))))..)))).))).))))))}.....,(({.........,,,).......,........{,((((((((....(((.....)))....)))))))),,)))))}.}}},.})).))))))))).)))))..))))))).......((((((((..((((...(((({...)))))...))))..))},)))))...}}}}..}...)))))}.(((((.((((.,,(((((....)))))...,|||,(((((({.{{{{{{{(.....,.....))))}}}.}))))))...,||,,..,..}}}).))))).......(((((((.((({....)))))))))))....,((((....)))).|.{(((((((...(((((({...})))))).{((((.((((({.,,.{((((({((((((((....................)))))))).{{{{...}})}.))))))}...||..)))}}}.||}||.......,,}}|{||{{{......))}.}},)))))))))))))))}..})),,....,(((((....})))||(({...((((({..{((.,,..((((((..((((.((((............(((.((((((((((({.(((((((((((((.{((.((((((((.((..(((....)))..)).))))))))...})}.........{(.(((..(((((.{(((((((((((........)))))..))))))}.....)))))..))))}((((..((((.((((.((.....)).)))).))))..)).)).(((...))}.)))))))))))))...,...,{((....))))))}}))))))))..))))))}.)))).)))))).,,))}))}}))))))}.....}))))),)}}}}.......||{.|||.{(|,|{,,,,.}))|},},,.....,,.....)))))))),,.......((((.((((...(((((,{(((....{((({{(({.((((((({{({{.........}}}}.((((((((........)))))))}..{{{{......)))|{{{,...........,,,.....}))))))).}))...........})))))},,,})))..))))).)))))).)).,.....,).))))))).))))),|{{.{,....,}},,,....{((((.{(((((((..........))))))))}.))))}(((((((..,..........,,.......))))))).(((((((((.,....}.))))))..))).((((((((...((((,,(((.((({((,,.((((....)))).)}))...})).))))))))..)))))))).}}{{{.,................................,...((((((((......))))))))...{(((((((......,.)))))))}.(((..((.....))..))),,}})
Forensic Context

No forensic context available.