Basic Information

Symbol
hsa_LPHN3_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0126730 hsa_circLPHN3_003 hsa-ADGRL3_0079
Host gene
LPHN3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
4:62119069-62121419 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:61253351-61255701 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-559.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -605.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 678.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.