Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0010900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0015
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107610819-107612512 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104848538-104850231 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-502.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -535.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 405.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(..(((((.((((((((((((((((((((((..(.(((.(((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((................(((((.((.....................)).)))))..(((.(((.((((((((((.....))))...........(((......)))..(((((.((.((((.(((.((((..(((((((((((((...)))))))......((((......))))..(((((.(((((....)))))...)))))..........(((((..((((..((((((..((((((.....)))))))))))))))))))))..((((((.((((((.(((((((((((((((((....)))))....(((((((((((((((....((...(((.(((((((((((.....(((((..(((((((((.(((...)))...)))...))))))..)))))..((((((..((((...(((((.....((((((.....(((((...((((.((((.((....((((.......)))))).))))))))...)))))...))))))......)))))...))))..))))))..((((.((.......)))))).......)))))))))))))).))....))))))..)))))).)))......(((((....)))))......)))))).....))))))))))))..)))))).(((((((..(((((((.(((.(((((((..........)))))))..))).)))))))..)))))))(((..............)))...........(((((.....(((((((.(((((.((.(((..((..((((((((....)))))))).))..))).))))))).....((((((.((((..((.(((((((..(((((....(((...((((((.(((((................)))))))))))))).....)))))...))))))).)).)))).)))))).......(((((((((((......((((..........)))).(((((....)))))....)))))))))))...))))))).......)))))...)))))).(((...(((((((((.(.(((.(...(((((...((((..((((((((((((((.((((((..((....))..)))))).((((....)))).......))))))...))))))))..)))).))))).).))).)))))))))).)))...((((((.((((((..(((((((((....))).).)))))))))))..))))))........)))).))).)))).))))))).......(((((((((...))))))))).........((.(((((((.(((...........((((.....))))((((((((...((.....))...))))))))......)))))))))).))..((((((.((((....))))...))))))...))))))))))))........((((((.(((((........))))).)))))).......................))))).)))))))))))))..))))))))))))))))).))).)..)))))))))))))))))))))).)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.........,...)(..(((((.((((((((((((((((((((((..(.(((.(((((((((((((((((,.(((((((((((((.(((((,{...,,,.,,,.,,,.{{{{{({,.....,{{{{{{......,,......,}..{||,(({.,,|||((({(,,,..}})),,,.,,,.....,|}}}}}}..{{.((((,{((.((((.((({(((,{{(((((,((((({,...}})))}},.{,..((((......))))..|,,,..{((((....))))}..||||||,..{{,,,,.(((((..((((..(((((({.((({({.....})))}))))))))))))))))..{({,,,{((((,,.|||||||{{{{,,.,{|||||}},})})}|||||||,((((........)))}{(((((.........)))))}..((({{((((.(((((((({{.{{{...,||||.,,....,,|||||,,((((((..((((...(((((...,,((((((.....(((((.,,(({{.((((.((....((((.......)))))).))))}))),..)))))...)))))),,....)))))...))))..))))))||||{{{|,|,,{{||..,,,..{{{{........,)))}.,(((((((..{({(({.,||||{{|||.,,,,.,{{{{.,,,)}))}}},...,}})}},.....,}},,,,}}}}...,,}|,,(((((((..(((((((.(((.(((((((..........)))))))..))).)))))))..)))))))|...............})))}}..}}}))}}|{{{{||...,,,((((.(((((.((.(((..((..((((((((....)))))))).))..))).)))))))...}}||,,,,.|||},,{{.(((((((..(((({..,,(((...((((((.(((((,{........,,....))))))))))))))....,)))))...))))))).)).))))})),})),)})))}}|||,,||||}}}}}..||||}}}.}}}},.,|||||||((,,,...|||...,},}}}}}}}},..,}}}}))),......,,,||.,,}|,|||{{{{...(((((((({{(.(((.{...(((({...((((..((((((((((((((.(((((({((.,,,.({..,,...,..)).,....))),,)))).)))))),..})))))))..)))).))))).).))).)))))))))).,,,,}}}}}}...((((((..(({(({(((....))).}.))))}))))))..,|||{{{{,.,.,)))))}))).)))).))))))).}}....(((((((((...)))))))))...,.,,.{(({((({{{(,,,{,,........((({{((((..((.((((((((...((....,)}...))))))))..))..)))))))).......((((((.((((....))))...))))))...})))),}},,,,........((((((.(((((........))))).))))))}})}}}}.,}}}}}}}}}}},.}))))).))))))))))))).,))))))))))))))))).))).)..)))))))))))))))))))))).)))))..)
Forensic Context

No forensic context available.