Basic Information

Symbol
hsa_LPHN3_0026400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0126763 hsa_circLPHN3_041 hsa-ADGRL3_0082
Host gene
LPHN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:62812632-62849321 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:61946914-61983603 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-222.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -235.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.....(((.(((((((((........))))...)))))))).....)))((.......((((((((((.(((((((.(((.((((((((...........((((((((((((..((((.(((.(((((((((((((((((((.....(((....)))...)))))))..))))...))))))))...((((((..........))))))))).))))......................(((((((...))))))).).)))))))))))............)))))))).)))..))))))).....((((((..(((.....))).)))))).......(((((......(((((...(((((((((.(((((((...((((..(((((...(((((.((......)))))))...)))))((((((.((....((((.(((.(((....((((((.((...(((...........)))....)).))))))....))).))).))))..))))))))......((((((..(((.....)))..)))))).))))))))).((((((..(((.......)))....)))))))).)))))))))...)))))..)))))..............((((((((((.((.(((...))).))..)))).)))))).....)))))))))).(((..((((..(.((((....)))).)..))))..)))(((((((.....((((((....((((...((((((((((((...)))))))))).))...))))..))))))..))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((.....(((.(((((,,((..,,,...))))}..)))))))).....)))((.......((((((((((.(((((((.(((.((((((((..,,.,{,...{((((((((((,..,....,{{,{({({{(((((({((((((.....({{,,,,,}}...)}}}})},,)))),.,)}}}}}}}...,|{{{,..........{(((((.{{.((..........}))).)))))}...{((((((...))))))}.}.)))))))))))..,})}),....)))))))).})},.))))))).....((((((..{{{.....})).)))))).......,{{{,......(((((...(((((((((.(((((((...((({..(((((...(((((.((......)))))))...)))))(((((,{((....((((.(((.(((....((((((.((...(((...........)))....)).))))))....))).))).))))..))))))))......((((((..(((.....)))..)))))).))))))))).((((((..{({.......}))....)))))))).)))))))))...)))))..}))),..............((((((((((.((.(({...})).))..)))).)))))).....)))))))))),{((..((((..,.((((....)))).}..))))..))}{((((((.....((((((....((((.,.((((((((((((...)))))))))).)).,.))))..))))))..))))))),))
Forensic Context

No forensic context available.