Basic Information
Symbol
hsa_LRBA_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0071141
hsa_circLRBA_121
Host gene
LRBA
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:151223777-151512011
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:150302625-150590859
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-555.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-594.98 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
505.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((.((((((((.(((...(((......))).(((((.(((((.((((((...((((((.(((.......)))....(((((...(((...(((((..(((((......((((.((((.(((((((...)))))))....(((((((((..((((((......))))))(.((((((((..(((((((.(((..((((..(((((.(..(((((((................)))))))..))))))..)))).))).))............((((....)))).....))))).)))))))).)......((((((....(((((((((((............)))).)))))))........))))))((((.((...(((((((((......))))))))).........))))))....(((....))).(((.(((.....))).)))...((((((((((((.(((.(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((((....)))))((......))....((....))......((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))).((((((...)))))).....((.(((((((.((((..(((.((((........)))).))))))).)))))))))...)))).))))......)))))..)))))...)))..)))))(((((..........))))).......((((((((((........((.(((((((((((..((((((...((((.....(((.....))).....))))....((((((((((((((....))).)))))))))))...................((((((((......))))))))((((.....))))))))))..)))))..))))))))))))))))))...((((...))))...)))))).))))))..))))).)))))........(((((...)))))((((((((.((((((...........)))))))))))))).((.(((((....))))).))(((((((...((((..((((((.............(((((((......))))))))))))).)))).(((((.(((........))).)))))(((((((.....(((((((.((((........((..((((........))))..))..((((.(((......))))))).....((((((((((((....(((.(((((((.((..(((......).))..)).)))))))..)))....(((....)))))))).)))))))............((((((.(.........).))))))))))...))))))))))))))..))))...))).......))))))))))).))))))((((...(((...((((((.((((((((...((((.(((((((............((((.((((.......((.(((((....))))).))....(((((...(((.((......)).))).))))).............(((.((.....))))).)))).))))))))))))))).......((((((.(((.(((((((.............(((((....(((((((((((((((((....((((..(((((((..((((((((((....((((((((..(((((...((...((((.((((((((.(((((((((....)))))))))......))))))))..)))))).))).)).))))))))...)).))))))))....).))))))...))))...))))))........((((((((.........)))))))))))))).)))))....))))))))))).).))).)))..)))....)))).))))))))))..)))..))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...,(((.((((((({{(((...(({.....,|||.(((((.(((((,((((,{{{.((((((.(((.......)))....(((((...(((...(((((..(((((......((((.{(((.(((((((...))))))).{(.((((((((({.((((((......))))))|,((((((((..(((((((.(((..((((..(((((({..(((((((....,,..........)))))))..))))))..)))).})}.}}............((({....}))).....))))).)))))))).,......((((((...{(((((((((((.,..........))))},))))))})......))))))((((,((.{.(((((((((......))))))))).}.}}....)}))))...,((,...,)},.{((.(((.....))).)))...((((((((((({{(({,(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((({....})))){{......},.{{,,,..,}),......((((((((((...............))))))))))}))))))}))))))))})(((({...})))),.....{(.(((((((.{(((..(((.((((........)))).))))))}.)))))))}}...)))}.))))......)))))..)))))...)))..)))))(((((..........))))).......((((((((((........,,.(((((((((((..((((((...(((...,,,.|||,|.,.....,....{{{{,.((((((((((((((....))).)))))))))))..................,((((((((......))))))))|,,,.,}}}),,,))))))..)))))..))))))},)))))))))}...{(({,.,,}}}...}))))).}}..})}}}}))).))))).......,(((((...)))))|{{(((({{((((({...........))))))))))}}}}.{{,(({{{....|||||,}}||,{{,{...((((..((((((.............{((((((......))))))))))))).)))).(((((.(((,,....}.))).)))})(((((((,....{{(((({.{(((,....,,{((..{{{,.,,..,})))}}.|)),.{{{{,(,(,,{...||,||}}..,.,{{{||{|||{{{....{|,.{{{{{{,.{|,.|||,|,{{{|{||{{||{(||||||{{|(,.....},.},}))}))))).)))}})))))},.,...,,||{{{{.,..,.,....)})))}}})}}}...}}))))))))))))..|||},},)))}..,}},))))))))))).))))))((((...(((...((((((.((((((((,,,,{{{,|((|{((,,,.,,{.....{|||,||||.......{{,((||{.,,,)))}),))....,{{{{..,{{{,|{|,.,..}}{|||.,}}}|.,,|}.......,|||{(({.....,,,)}))},.}}},||||}}||}||,......|||.}|.,,,}|{||{{,..,.,,,,,{{{,{((((,,..{{{{(((({{{,{{{((....{({{..{{{{{{|||||{{{{||||,,,,{{{|||{{,,||{||,,,{{.,.{{{{.{{{|||||{{((((((((....)))))))))||,,,,|||}}}}|,,||}|||,}}}.||,,}|||||}...}))))))})))}|.,|,|||}||,,,}|||,}.,}))))........((((((((.........)))))))))))))).)))))},..)))))})})))}),},,}))},)))}....)))),))))))))))..)))..))).)
Forensic Context
No forensic context available.