Basic Information
Symbol
hsa_FAM120A_0008300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0087555
hsa_circFAM120A_037
hsa-FAM120A_0014
Host gene
FAM120A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:96289437-96312973
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:93527155-93550691
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-282.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-299.11 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
244.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((...........))))))((..(((.....((....)).(((.((((.((((((.((.((((.....((.(((........((((((........((((.(((((((((((..((......)).(((((((((((..(((.....)))..((((((.........(((..(((((...........)))))..))).))))))....((((((((...(((........)))...)))))).))((((((((((((..((((.......(((((........))))).(((((((.(((((((.....)))).(((((((....))..)))))))).)))))))...((.....)).)))).)).))))))))))..((((.((((.((((..(((((...(((.(......(((((......)))))......).)))...)))))..)))).)))).)))).........((((.(((((...((((...(((..(((((....)))))...))).....((((.....))))........))))))))).))))))))))))))).(((.((......)))))..))))))))))).)))).((((((.(..(((((.((....((...(((((.((.(((...(((.(((((.....))))))))..))))).)).)))))..)))))))..).))))))..((((....)))).))))))((((((..((((.(((......)))))))..)).)))).......((((((..(((((((........))))))).))))))))))).....)))).)).))))))...))))...)))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((..((((.....(({{,{(((((((((...{(((((,,.{((((.((((((((..((({(.(...((((.({.........(((((..((({..{((.,,{,,,...,,))}}}}}..)}.))){,(((((.((((.((..,.(((((...)))}}}}...)))).)))))||{({,{(((.{{,...|,.....).)}),))}}...,....}}.))))...,,).)))..)))))))).)))||(((((((({(..((((,......(((((........))))).(((((((.{{{,(((.....)))|,(({{,{,....,}.,}))))}}}.)))))))...{{.....)}.)))).))}))))))))||..((((.((((.((((..(((((.,.(((.,.,..,.(((((......)))))....}.,,)),...)))))..)))).)))).))))..,....}.))))).,.....))))).))))),))).........|(((.{((((......}.))),})}))},...))))}}..)))((..((((((((,(((((((..(.((.....,)))..)))))))||{{{({(((((((,..,(((((,,.,,......,}}||((({((.((({,.,,{.|||||,{,,,,|||,||...,))},,)),}|}|,..|||,||{..{.{({{{{..,(((....||||{..,,,,|||||,..,}}}...}}).))}))))),)))}),},,))}))}.{((((((..(((((((........))))))).))))))),,.)}},,..,)))),,)))).....,,,,)))))))),.))
Forensic Context
No forensic context available.