Basic Information

Symbol
hsa_LPAR1_0002300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0087958 hsa_circLPAR1_018 hsa-LPAR1_0071
Host gene
LPAR1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:113703701-113734500 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:110941421-110972220 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-267.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -283.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 225.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((((((.....((.((((........).))))).....((((.((((((((((((..(((((((((((((...((((((....(((((((((..(((..((.((((((.........((......((((.((((((...((((((.((((((((((.((((.((((((.(((.....(((((((((((((..(((...........((((.(((...))).)))).((.((.....)).))...)))..)))))).)))))))))).))))))..)).)))))))...((.((((((((((..(((...(((((((.....)))).))))))((..(((.((..(((((........)))))..))..)))..)).(((((....))))))))))))))).)).......((((((.((((((((...((.......))...)))..)))).).))))))......(((((((................)))))))(((...(((((((......))))))))))....(((..(((.....(((....)))..)))..)))(((((..((...((((.((.....((((((((((((((...((((.....)))))))))))))))))))).))))...))..))))))))))))))))...)))))).)))).....)).......)))))).)).....(((.((((.......))))..))).((((.........))))))))))))))))...))))))....)))))))....(((((((.......)))))))(((((((.((.....))..)))))))((((...)))))))))))))))......))))))).)))))))).))))).)((.......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,,,,,,,,,.,,.{(({((({,.{,.,,{,.||||,....,(((,.{(({(({(((((..(((((((((((((...((((((....(((((((((..(((,.((.((((((.........{{......((((.((((((...((((((.(((((((({{.((((,((((((,((({....,((((((((((((..({,...........((((.,((...))}.)))).{,.{{.....||,||,,.,}},,||||}||||}}}}}}}}.}}}}}}..}}.,,}})}}...((.((((((((((..(((...(((((((.....)))),,)))))((..(((.{(..(((((........)))))..))..)))..)).(((({....})))))))))))))).))........,,{({.{{{{||||}.}||,.,,,..))...))),,))),.}}),})))}},...{(((({(,{,....,,,,..,,||||}}}}(((...(((((((......))))))}}}}....{|||||||,....,||,,,.}}}..))}.,|||,,{,|,,||,,}|||..||,,}}}||{{|||{{{{||,,|,||{(.....)))}}}))))))}}}}}|||||}}},}}})),)}})})))))))))))...)))))).)))).....}).......)))))).)}.....(((.((((.......))))..))).{(((.........))))))))))))))))...))))))....}))))))....(((((((.......)))))))(((((((,((....,))..)))))))((((...)))))))))))))))......)))}}}),))))))))},))}))))}..,}}},.)
Forensic Context

No forensic context available.