Basic Information

Symbol
hsa_LPAR1_0002400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0003611 hsa_circLPAR1_016 hsa-LPAR1_0005
Host gene
LPAR1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:113703701-113735838 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:110941421-110973558 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-289.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -306.5 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.9
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((.((........)).).))))((..(((.....((.((((((((......(((.......)))......)))))))).))(((......)))((((((.((.(((..((((.....((((..(((.((.(((((..(((((((((((((...((((((....(((((((((..(((..((.((((((.........((......((((.((((((...((((((.((((((((((.((((.((((((.(((.....(((((((((((((..(((...........((((.(((...))).)))).((.((.....)).))...)))..)))))).)))))))))).))))))..)).)))))))...((.((((((((((..(((...(((((((.....)))).))))))((..(((.((..(((((........)))))..))..)))..)).(((((....))))))))))))))).)).......((((((.((((((((...((.......))...)))..)))).).))))))......(((((((................)))))))(((...(((((((......))))))))))....(((..(((.....(((....)))..)))..)))(((((..((...((((.((.....((((((((((((((...((((.....)))))))))))))))))))).))))...))..))))))))))))))))...)))))).)))).....)).......)))))).)).....(((.((((.......))))..))).((((.........))))))))))))))))...))))))....)))))))....(((((((.......)))))))(((((((.((.....))..)))))))((((...))))))))))))))).))...)))...))))))))))).)).)))))).)))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(((,.{(........}}.}.))}}{{..{{{.....{,,(({(((((....}}|||,,,....}}}..|{,,|||}|}}|,||(((,,....}||.((({,.,,.,,,}.}}||}....,({{,.,{||||,(((((..(((((((((((((...((((((....(((((((((..(((,.((.((((((.........{{......((((.((((((...((((((.(((((((({{.((((,((((((,((({....,((((((((((({..({,...........((((.,((...))}.)))).{,.{{.....||,||,,.,}},,||||}||||}}}}}}}}.}}}}}}..}}.,,}})}}...((.((((((((((..(((...(((((((.....)))),,)))))((..(((.{(..(((((........)))))..))..)))..)).(((({....})))))))))))))).))........,,{({.{{{{||||}.}||,.,,,.,))...))),,))),.}}),)))}}}|...{(((({({{,....,,,,..,,||||}}||(((.,.(((((((......))))))}}}}....{|||||||,....,||,,,.}})..))}.,|||,.{,|,,||,,}|||..||,,}}}||{{||||{{|||,,|,||{(..,..))}}}}))))))}}}}}|||||}}},}}})),)}})))))))))))))...)))))).)))).....}).......)))))),)}.....(((.((((.......))))..))).{(((.........))))))))))))))))...))))))....}))))))....(((((((.......)))))))(((((((,((...,,))..)))))))((((...))))))))))))))).,,.,,}}},|||||}}}})))})))})}}),,.))),.))
Forensic Context

No forensic context available.