Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0011200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0034
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:107617422-107651476 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104855141-104889195 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-492.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -526.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 441.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..(((((((((((..(((.........(((.....)))..(((((((.(((((((((.(((.........(((..............)))...........))))).)))..((((((...((((((((.(((((((((.((((....((((((..((((.....))))..)))))).(((((((.((((....)))))))))))..((((((((..((((..((....(((((....(((((((((((((.....((..((((((.........))))))..)).(((((.....))))))))....))))))))))....(((((..((.((((((.((((((....)).))))....)))))).))(((((((..((..((......))..)).))).))))......((((((......((((((.((((((.((.((...(((((..((.(((.((((....(((.....(((...(((((..(((.(((((........((((((((((((((...((....))..))))))..(((((((.(((.((((((....)))))).)))..)))))))((((..(((.(((.......))).))).))))(((...(((((.((((((...((......))...))))))..)))))...)))))))))))..((((........))))...))))).))).))))).))))))))))))))).))))).(((((.(((((((((...)))))))..)).))))))).))))).)))..)))))).......))))))........((((((((((.((........).).).))))))))).)))))...)))))..))..))))))))))))(((.((((((.(((((...(((((....(((((((...((((..(.((((((.(((..(((((((...(((((((((((..((((((((..(((.(((((((.(..((((((.((((...........))))))))))..).))))))).))).....))).)))))..))))))).......))))....)))))))..)))..)))))).)......((((((((.(((..(((((.(.(((...(((((((.(((.....))).(((((........)))))..........(((((((..........)))))))..(((((((..(..(.....)..)...))))))))))))))))).)))))).))).)).))))))((((........))))....((((.((((..(((((....(((((((.(((...)))...)))))))...)))))...))))))))............))))...))).))))(((((.(((......))).)))))...)))))...))))))))))).)))......)))).)))))))))))))))))....)))))).)))).)))))))..))))))).))))))))))).))))).((((((((...))))))................(((((((....))))))).....(((......)))...((((.......)))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((((,{,,}}}},.||,||{,},))|.,,.......,,.(((((.(((((((...,((((((((.((.(((((.,{(((.....)))}..(((((((((((.......,(((((..,.,(((((({,...{||||{(,,..}}}))}|,,.,}}})}.{(((((.{{{..(((((((((.(((((({.{.((((((((((,({.(((..,,,,{(({{{||,,||||.|||....{{(((....((((((((((,(({..,.((..((((((.........))))))..)).(((((.....))))),),.}}}))))))))))....|||{{,,{{.((((((.((((((....)),,)))....)))))},}}((((({(,,(({{(({.....))}}}}.|||.||||....,,{((({,..,,{,{{{{{|.|||||,|||.|{..,||{{{,.{{|||||{|||,,..||,....{((({(((((..{{(,,....})),,.))))).))))}(((((((...((....))..))))))).(((((((.(((.((((({....}))))).))).,,)))))){{{{{,{((.((({{.{{.{|(({||,.,|))}}}|{.{((((.((((((...((......))...))))))..))))),....,.,|{|||,||((((.....,,,))))...,,))))})}.}),)),)},,}}}}}}}|}}}.}}|}|.(((((.,((((((((,..}}})))}||}|.}}}}|}},}}}}}.}|}..}})))}.,}}.,.}))))},,,,....|{{{{{{|||,||,..,},,,,.),}.))))))))),}}}},..,)))}}.,))..}}))}))))))))).))))))))}}))),.,},)))))...)))))))))).))}}))))}.}))})))))),.})))))}.))))).)).)))))))),{((((((({{{...{{(({.(((((((.((((((.(({....))).)).)))).)))))))....})}},((((((((...((((((.....,,,...............{.((((((((((((({,....}})})),,.)))))))).,,{||}|||{(((((((,.(({{(({(({.(({{{........|||||....,},,,,(((((((..........)))))))..(((((((..,,.{.....}..,...))))))|||||,,,..,.}||||,,||}}|||||}...{{|||||...})))})}|..((((.((((..(((((.,..(((((((.(({...}))...))))))).,.)))))...)))))))).........,,,,....,,}}))))))}|{((.(((......)}).))))}...)))}}})},,)))))))))))))).{{,{.....}))))))))))}.(((((((..(((((((((.((....))))}}))))))))))).))...,.((((((((...)))))))).}.................(((((((....)))))))))))))).))))).,.....{{{,.......})))...,
Forensic Context

No forensic context available.